RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 TRIM27P14373 513 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 BTDP43251 543 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 MAP3K10Q02779 954 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 RFX7Q2KHR2 1363 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 MOGSQ13724 837 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 ZHX2Q9Y6X8 837 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 PSMC4P43686 418 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 GSTO1P78417 241 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 MECOMQ03112 1051 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 AK9Q5TCS8 1911 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 LDHCP07864 332 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 PTPRAP18433 802 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 PICALMQ13492 652 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 SPATA5Q8NB90 893 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 SH3TC2Q8TF17 1288 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 SRRDQ9UH36 339 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 ADGRA2Q96PE1 1338 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 NPM3O75607 178 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 TRIM47Q96LD4 638 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 GPAT2Q6NUI2 795 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 BCAR3O75815 825 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 RAET1EQ8TD07 263 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 MYH2Q9UKX2 1941 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRN-215ENST00000484986 TBC1D12O60347 775 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 OSBPP22059 807 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 MYCP01106 439 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 CYP2C8P10632 490 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 BCRP11274 1271 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 FCGRTP55899 365 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 RHBDL3P58872 404 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 RAI14Q9P0K7 980 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 MYPNQ86TC9 1320 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 CTGFP29279 349 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 GADL1Q6ZQY3 521 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 DOCK2Q92608 1830 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 GRK4P32298 578 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF384Q8TF68 577 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 PI16Q6UXB8 463 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 GPR108Q9NPR9 543 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 TRIM75PA6NK02 468 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 TNNQ9UQP3 1299 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
PTPRN-215ENST00000484986 MCAMP43121 646 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 BAG3O95817 575 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 UBXN2AP68543 259 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 PRKCZQ05513 592 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 POLA2Q14181 598 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 TEX11Q8IYF3 940 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 SLAIN1Q8ND83 568 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 PNMA3Q9UL41 463 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 IGSF3O75054 1194 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 SLURP2P0DP57 97 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 PLCG2P16885 1265 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 MTFR1Q15390 333 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 ATP8B2P98198 1209 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 TNNI3KQ59H18 835 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms