RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.47■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 GCC1Q96CN9 775 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 WNK4Q96J92 1243 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.46■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.45■■□□□ 1.67
ACTB-211ENST00000480301 PLCG2P16885 1265 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 VGLL4Q14135 290 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 WRNIP1Q96S55 665 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 ELP3Q9H9T3 547 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 DOCK2Q92608 1830 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 PDE6AP16499 860 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 GJA5P36382 358 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.44■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K10Q02779 954 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 CSADQ9Y600 493 aa25.43■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 OTOFQ9HC10 1997 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 CA12O43570 354 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 IGHDP01880 384 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 TM4SF4P48230 202 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 GPATCH3Q96I76 525 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.42■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 SLURP2P0DP57 97 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 INPP5BP32019 993 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 RNF186Q9NXI6 227 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 TSKSQ9UJT2 592 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 AK9Q5TCS8 1911 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 LBX1P52954 281 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 SMC5Q8IY18 1101 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 OPTNQ96CV9 577 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 FLT1P17948 1338 aa25.39■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.39■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.39■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 CERS3Q8IU89 383 aa25.39■■□□□ 1.66
ACTB-211ENST00000480301 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D12O60347 775 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 TRPA1O75762 1119 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 ADD2P35612 726 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 SREBF2Q12772 1141 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 CHGBP05060 677 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 ERO1BQ86YB8 467 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 MX1P20591 662 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 INHBEP58166 350 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 OTUD5Q96G74 571 aa25.36■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.658e-19■□□□□ 10.2
ACTB-211ENST00000480301 ERC2O15083 957 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 UBE3CQ15386 1083 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 FAM196BA6NMK8 535 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.652e-7■■□□□ 13.5
ACTB-211ENST00000480301 PALD1Q9ULE6 856 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 USP5P45974 858 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 PPATQ06203 517 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 LCORLQ8N3X6 602 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 STAP2Q9UGK3 403 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ACTB-211ENST00000480301 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
ACTB-211ENST00000480301 IRF6O14896 467 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-211ENST00000480301 PPIL2Q13356 520 aa25.32■■□□□ 1.64
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