RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	IGSF3	O75054	1194 aa		10.32	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		10.32	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.32	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	CNTROB	Q8N137	903 aa		10.32	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	CERS5	Q8N5B7	392 aa		10.32	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		10.32	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	TFCP2	Q12800	502 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	MRI	Q9BWK5	157 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.31	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	SHTN1	A0MZ66	631 aa		10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	WNT10B	O00744	389 aa		10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	EGFR	P00533	1210 aa		10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	CCDC102B	Q68D86	513 aa		10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	RAB11FIP3	O75154	756 aa		10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	GGA3	Q9NZ52	723 aa		10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		10.29	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	MYO1B	O43795	1136 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	PHKA1	P46020	1223 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	SCARF1	Q14162	830 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	MXD3	Q9BW11	206 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	DOCK2	Q92608	1830 aa		10.28	□□□□□ -0.76
USP34-208	ENST00000467128	DNAJB2	P25686	324 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ADORA1	P30542	326 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	GGCX	P38435	758 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TIMM10	P62072	90 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	DLGAP5	Q15398	846 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TEKT1	Q969V4	418 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	RASSF10	A6NK89	507 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	FKBP1B	P68106	108 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	TNFAIP1	Q13829	316 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CFAP100	Q494V2	611 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	SPATA5	Q8NB90	893 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	LAMB1	P07942	1786 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CNTNAP1	P78357	1384 aa		10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	RCCD1	A6NED2	376 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CRK	P46108	304 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		10.25	□□□□□ -0.77
USP34-208	ENST00000467128	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77

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