RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 MECOMQ03112 1051 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 ARHGEF6Q15052 776 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 SIPA1L1O43166 1804 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 BTDP43251 543 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 RHBDL3P58872 404 aa22.09■■□□□ 1.13
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SIKE1-205ENST00000466657 SPATA5Q8NB90 893 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 SSH3Q8TE77 659 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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SIKE1-205ENST00000466657 SLC34A2O95436 690 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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SIKE1-205ENST00000466657 C17orf99Q6UX52 265 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 PI16Q6UXB8 463 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 MIER1Q8N108 512 aa22.08■■□□□ 1.13
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SIKE1-205ENST00000466657 GPR108Q9NPR9 543 aa22.08■■□□□ 1.13
SIKE1-205ENST00000466657 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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SIKE1-205ENST00000466657 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
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SIKE1-205ENST00000466657 ZNF333Q96JL9 665 aa22.06■■□□□ 1.12
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SIKE1-205ENST00000466657 GORABQ5T7V8 394 aa22.05■■□□□ 1.12
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SIKE1-205ENST00000466657 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.05■■□□□ 1.12
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SIKE1-205ENST00000466657 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.04■■□□□ 1.12
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SIKE1-205ENST00000466657 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.04■■□□□ 1.12
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SIKE1-205ENST00000466657 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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SIKE1-205ENST00000466657 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.01■■□□□ 1.11
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SIKE1-205ENST00000466657 CPA4Q9UI42 421 aa22.01■■□□□ 1.11
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SIKE1-205ENST00000466657 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.01■■□□□ 1.11
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SIKE1-205ENST00000466657 BCRP11274 1271 aa22■■□□□ 1.11
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SIKE1-205ENST00000466657 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22■■□□□ 1.11
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SIKE1-205ENST00000466657 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.97■■□□□ 1.11
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SIKE1-205ENST00000466657 CYP2C8P10632 490 aa21.96■■□□□ 1.11
SIKE1-205ENST00000466657 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SIKE1-205ENST00000466657 PSMC4P43686 418 aa21.96■■□□□ 1.11
SIKE1-205ENST00000466657 PPP4CP60510 307 aa21.96■■□□□ 1.11
SIKE1-205ENST00000466657 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SIKE1-205ENST00000466657 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
SIKE1-205ENST00000466657 SNRKQ9NRH2 765 aa21.96■■□□□ 1.11
SIKE1-205ENST00000466657 OSBPP22059 807 aa21.95■■□□□ 1.1
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