RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 USP47Q96K76 1375 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 M0R2N6 131 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 DLL1O00548 723 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 C21orf2O43822 256 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 DKK1O94907 266 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ARAFP10398 606 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ZMYND15Q9H091 742 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 PIM2Q9P1W9 311 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.33□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ITPK1Q13572 414 aa6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 DGKZQ13574 1117 aa6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 CEP63Q96MT8 703 aa6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 MARK1Q9P0L2 795 aa6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 HCN2Q9UL51 889 aa6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 PALLDQ8WX93 1383 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 FAM196BA6NMK8 535 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 FAM157BP0CG42 384 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 SSFA2P28290 1259 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.31□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 RASSF10A6NK89 507 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 AOC2O75106 756 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 GRM1Q13255 1194 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 CHSY3Q70JA7 882 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.3□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 NFKBIEO00221 500 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 GYS1P13807 737 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 LMNB1P20700 586 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 FBLN1P23142 703 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ADH6P28332 368 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 TMF1P82094 1093 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 SUSD3Q96L08 255 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 BRD7Q9NPI1 651 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 MEGF6O75095 1541 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.29□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 C4AP0C0L4 1744 aa6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 LTBP1Q14766 1721 aa6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 BTBD11A6QL63 1104 aa6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 EFSO43281 561 aa6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 DDR1Q08345 913 aa6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 ARTNQ5T4W7 220 aa6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 PIGBQ92521 554 aa6.28□□□□□ -1.4
CNN3-204ENST00000461018 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 LAMC2Q13753 1193 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 SYT9Q86SS6 491 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 NBPF11Q86T75 865 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 NME9Q86XW9 330 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 CAPNS2Q96L46 248 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 SLC30A3Q99726 388 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 PLVAPQ9BX97 442 aa6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CNN3-204ENST00000461018 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms