RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 TRPA1O75762 1119 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 LCA5LO95447 670 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PDE6CP51160 858 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SNX32Q86XE0 403 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 DSEQ9UL01 958 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PDCP20941 246 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2HP62256 183 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 IGBP1P78318 339 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 BNIP1Q12981 228 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CBX3Q13185 183 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 FLOT2Q14254 428 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CAMK4Q16566 473 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ANO10Q9NW15 660 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 INTUQ9ULD6 942 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CTAGE9A4FU28 777 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CYP11B2P19099 503 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CUL5Q93034 780 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GUCY1B2O75343 617 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ALDH3A1P30838 453 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PAFAH1B1P43034 410 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GUCY1B3Q02153 619 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 FLIIQ13045 1269 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 RASA3Q14644 834 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ERICH2A1L162 156 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC151A5D8V7 595 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SYCE1LA8MT33 242 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PDE5AO76074 875 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.24□□□□□ -1.41
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PTPRC-209ENST00000442510 ATP2A3Q93084 1043 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 OMA1Q96E52 524 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 LNPKQ9C0E8 428 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 RNF40O75150 1001 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PDHA1P08559 390 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 NAT2P11245 290 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 TUBB2AQ13885 445 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SKA1Q96BD8 255 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 STMND1H3BQB6 276 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 STAM2O75886 525 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC159P0C7I6 412 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 PYGBP11216 843 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GPTP24298 496 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 LRPAP1P30533 357 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO41Q8TF61 875 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 OLFM3Q96PB7 478 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 CPLX1O14810 134 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 MAN1A2O60476 641 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 KRT5P13647 590 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-209ENST00000442510 SCNN1BP51168 640 aa6.23□□□□□ -1.41
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