RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.63■□□□□ 0.57
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HERC3-206ENST00000431413 PICK1Q9NRD5 415 aa18.63■□□□□ 0.57
HERC3-206ENST00000431413 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.63■□□□□ 0.57
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HERC3-206ENST00000431413 PI16Q6UXB8 463 aa18.62■□□□□ 0.57
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HERC3-206ENST00000431413 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.62■□□□□ 0.57
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HERC3-206ENST00000431413 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.61■□□□□ 0.57
HERC3-206ENST00000431413 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.61■□□□□ 0.57
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HERC3-206ENST00000431413 C17orf99Q6UX52 265 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 TEX11Q8IYF3 940 aa18.57■□□□□ 0.56
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HERC3-206ENST00000431413 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
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HERC3-206ENST00000431413 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 CAP1Q01518 475 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 MOGSQ13724 837 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 GADL1Q6ZQY3 521 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 PANK1Q8TE04 598 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 PSMC4P43686 418 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 PPP4CP60510 307 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 GPAT2Q6NUI2 795 aa18.53■□□□□ 0.56
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HERC3-206ENST00000431413 ZNF333Q96JL9 665 aa18.53■□□□□ 0.56
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HERC3-206ENST00000431413 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
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HERC3-206ENST00000431413 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 PI4KBQ9UBF8 816 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC3-206ENST00000431413 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 ADGRA2Q96PE1 1338 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 POTEFA5A3E0 1075 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 CYP2C8P10632 490 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
HERC3-206ENST00000431413 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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