RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WNK4Q96J92 1243 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ECHDC1Q9NTX5 307 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BAG3O95817 575 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GJA5P36382 358 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCAF15Q66K64 600 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BEGAINQ9BUH8 593 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ELP3Q9H9T3 547 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAG1Q9NWQ8 432 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLURP2P0DP57 97 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSHZ3Q63HK5 1081 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MIGA1Q8NAN2 632 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WRNIP1Q96S55 665 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF341Q9BYN7 854 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSKSQ9UJT2 592 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF112Q9UJU3 913 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDE6AP16499 860 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLCG2P16885 1265 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LBX1P52954 281 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP3K10Q02779 954 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GCC1Q96CN9 775 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF186Q9NXI6 227 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGHDP01880 384 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 INPP5BP32019 993 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TM4SF4P48230 202 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OPTNQ96CV9 577 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSADQ9Y600 493 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CA12O43570 354 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLFNL1Q499Z3 407 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF532Q9HCE3 1301 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHF20L1A8MW92 1017 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FLT1P17948 1338 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHGBP05060 677 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPATCH3Q96I76 525 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AK9Q5TCS8 1911 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SALL3Q9BXA9 1300 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRPA1O75762 1119 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMC5Q8IY18 1101 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPDYE5A6NIY4 337 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADD2P35612 726 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SREBF2Q12772 1141 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PI4K2BQ8TCG2 481 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRDM10Q9NQV6 1147 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTC41PQ6P2S7 1318 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM196BA6NMK8 535 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CERS3Q8IU89 383 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OTUD5Q96G74 571 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D12O60347 775 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERO1BQ86YB8 467 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MX1P20591 662 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PALD1Q9ULE6 856 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 INHBEP58166 350 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FOCADQ5VW36 1801 aa30.24■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP30.23■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFNL1Q8IU54 200 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCORLQ8N3X6 602 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPN18Q99952 460 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP30.23■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PI4KBQ9UBF8 816 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LAMB1P07942 1786 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IRF6O14896 467 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP5P45974 858 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPIL2Q13356 520 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE3CQ15386 1083 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KBTBD3Q8NAB2 608 aa30.22■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERC2O15083 957 aa30.21■■■□□ 2.43
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