RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.96□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.96□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.96□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 F13A1P00488 732 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ADH5P11766 374 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 PREPP48147 710 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 CDK8P49336 464 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 INPP5AQ14642 412 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 CSADQ9Y600 493 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 TMPRSS2O15393 492 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 TIAF1O95411 115 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 GARTP22102 1010 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 GATA4P43694 442 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 Q6ZS46 218 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 DYMQ7RTS9 669 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 C12orf40Q86WS4 652 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 SPON2Q9BUD6 331 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ID3Q02535 119 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 FBXO27Q8NI29 283 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 FAM221AA4D161 298 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 BPNT1O95861 308 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 PICK1Q9NRD5 415 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 UBP1Q9NZI7 540 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 GREM1O60565 184 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 CILPO75339 1184 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ASPAP45381 313 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 CRKP46108 304 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 TNNI2P48788 182 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 USP11P51784 963 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 PPM1JQ5JR12 505 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 HDXQ7Z353 690 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 DISC1Q9NRI5 854 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.91□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 APOBRQ0VD83 1088 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 PAK2Q13177 524 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 TTLL4Q14679 1199 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 SGO2Q562F6 1265 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 TP53INP1Q96A56 240 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 PIDD1Q9HB75 910 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-211ENST00000426951 GFRA2O00451 464 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 FURINP09958 794 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 BMP3P12645 472 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 RAB6AP20340 208 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 RXRBP28702 533 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 ERVK-24P63145 666 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 MPP2Q14168 576 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 UVSSAQ2YD98 709 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 MYRFLQ96LU7 910 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 CAPN10Q9HC96 672 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-211ENST00000426951 GRIN3BO60391 1043 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms