RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 WRNIP1Q96S55 665 aa30.4■■■□□ 2.46
HTATSF1-202ENST00000425695 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1-202ENST00000425695 IGSF3O75054 1194 aa30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1-202ENST00000425695 LBX1P52954 281 aa30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP4CP60510 307 aa30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1-202ENST00000425695 AAMPQ13685 434 aa30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1-202ENST00000425695 MIGA1Q8NAN2 632 aa30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF341Q9BYN7 854 aa30.39■■■□□ 2.46
HTATSF1-202ENST00000425695 OTOFQ9HC10 1997 aa30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 VGLL4Q14135 290 aa30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 HAUS7Q99871 368 aa30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ECHDC1Q9NTX5 307 aa30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PAG1Q9NWQ8 432 aa30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CSADQ9Y600 493 aa30.38■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PLCG2P16885 1265 aa30.37■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TSHZ3Q63HK5 1081 aa30.37■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 DOCK2Q92608 1830 aa30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SLURP2P0DP57 97 aa30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 GJA5P36382 358 aa30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa30.36■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPA1O75762 1119 aa30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 OPTNQ96CV9 577 aa30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 GPATCH3Q96I76 525 aa30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF186Q9NXI6 227 aa30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 NPM3O75607 178 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE6AP16499 860 aa30.34■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 INPP5BP32019 993 aa30.34■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa30.34■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 CA12O43570 354 aa30.33■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 GCC1Q96CN9 775 aa30.33■■■□□ 2.45
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF532Q9HCE3 1301 aa30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TM4SF4P48230 202 aa30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.32■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SREBF2Q12772 1141 aa30.31■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 OTUD5Q96G74 571 aa30.31■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF112Q9UJU3 913 aa30.31■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ATRNL1Q5VV63 1379 aa30.3■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SLFNL1Q499Z3 407 aa30.3■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM196BA6NMK8 535 aa30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 IGHDP01880 384 aa30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PRDM10Q9NQV6 1147 aa30.29■■■□□ 2.44
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HTATSF1-202ENST00000425695 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa30.29■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 FLT1P17948 1338 aa30.28■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 USP5P45974 858 aa30.28■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ERO1BQ86YB8 467 aa30.28■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SPDYE5A6NIY4 337 aa30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 PHF20L1A8MW92 1017 aa30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 CHGBP05060 677 aa30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.27■■■□□ 2.44
HTATSF1-202ENST00000425695 ADD2P35612 726 aa30.26■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP3K10Q02779 954 aa30.26■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa30.26■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PALD1Q9ULE6 856 aa30.26■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 INHBEP58166 350 aa30.25■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CERS3Q8IU89 383 aa30.25■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 TTC41PQ6P2S7 1318 aa30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D8O95759 1140 aa30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 MX1P20591 662 aa30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PI4KBQ9UBF8 816 aa30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 FOCADQ5VW36 1801 aa30.24■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 ERC2O15083 957 aa30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D12O60347 775 aa30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 IFNL1Q8IU54 200 aa30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 SMC5Q8IY18 1101 aa30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa30.23■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 IRF6O14896 467 aa30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 GTF2A2P52657 109 aa30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 LCORLQ8N3X6 602 aa30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PI4K2BQ8TCG2 481 aa30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 LNPKQ9C0E8 428 aa30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 ARMT1Q9H993 441 aa30.22■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa30.21■■■□□ 2.43
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