RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 WNK4Q96J92 1243 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF186Q9NXI6 227 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 TSKSQ9UJT2 592 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCG2P16885 1265 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 VGLL4Q14135 290 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 WRNIP1Q96S55 665 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 CSADQ9Y600 493 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 HAUS7Q99871 368 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPA1O75762 1119 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 GJA5P36382 358 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 OPTNQ96CV9 577 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP4-204ENST00000416021 INHBEP58166 350 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 SREBF2Q12772 1141 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 INPP5BP32019 993 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K10Q02779 954 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 GCC1Q96CN9 775 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 GPATCH3Q96I76 525 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE6AP16499 860 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 ERO1BQ86YB8 467 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF20L1A8MW92 1017 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 SLURP2P0DP57 97 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 CERS3Q8IU89 383 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D12O60347 775 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 OTUD5Q96G74 571 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP4-204ENST00000416021 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNL1Q8IU54 200 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.685e-7■■□□□ 14.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 FLT1P17948 1338 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D8O95759 1140 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHDP01880 384 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 ADD2P35612 726 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 USP5P45974 858 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF2A2P52657 109 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 PPATQ06203 517 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 PALD1Q9ULE6 856 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPN18Q99952 460 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 IRF6O14896 467 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH1A1P00352 501 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIL2Q13356 520 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM196BA6NMK8 535 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 ERC2O15083 957 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE3CQ15386 1083 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 PICK1Q9NRD5 415 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CHGBP05060 677 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 MX1P20591 662 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAPC2Q13487 334 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL15Q16663 113 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP4-204ENST00000416021 SMC5Q8IY18 1101 aa25.51■■□□□ 1.67
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