RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409958.6

VSX1-204, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VSX1, Length 1,305 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-204ENST00000409958 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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VSX1-204ENST00000409958 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.2■■□□□ 1.62
VSX1-204ENST00000409958 CERS3Q8IU89 383 aa25.2■■□□□ 1.62
VSX1-204ENST00000409958 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.2■■□□□ 1.62
VSX1-204ENST00000409958 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.19■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.19■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 CA12O43570 354 aa25.18■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.18■■□□□ 1.62
VSX1-204ENST00000409958 WNK4Q96J92 1243 aa25.18■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 CSADQ9Y600 493 aa25.18■■□□□ 1.62
VSX1-204ENST00000409958 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
VSX1-204ENST00000409958 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.18■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-204ENST00000409958 ELP3Q9H9T3 547 aa25.16■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.14■■□□□ 1.62
VSX1-204ENST00000409958 ERC2O15083 957 aa25.14■■□□□ 1.62
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VSX1-204ENST00000409958 FLT1P17948 1338 aa25.14■■□□□ 1.61
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VSX1-204ENST00000409958 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.6
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VSX1-204ENST00000409958 NUCB1Q02818 461 aa25.07■■□□□ 1.6
VSX1-204ENST00000409958 PPATQ06203 517 aa25.07■■□□□ 1.6
VSX1-204ENST00000409958 PPIL2Q13356 520 aa25.07■■□□□ 1.6
VSX1-204ENST00000409958 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.07■■□□□ 1.6
VSX1-204ENST00000409958 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.07■■□□□ 1.6
VSX1-204ENST00000409958 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.07■■□□□ 1.6
VSX1-204ENST00000409958 PALD1Q9ULE6 856 aa25.07■■□□□ 1.6
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