RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 SULF2Q8IWU5 870 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 KCNB2Q92953 911 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 BCO2Q9BYV7 579 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 CEACAM5P06731 702 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 ARNTP27540 789 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 OXCT1P55809 520 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 PI16Q6UXB8 463 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 C14orf37Q86TY3 774 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 RNF214Q8ND24 703 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 STK35Q8TDR2 534 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 U3KQE9 123 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 LEFTY1O75610 366 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 NME2P22392 152 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 TMC7Q7Z402 723 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 ISL2Q96A47 359 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 RETREG2Q8NC44 543 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 DSC3Q14574 896 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 LCE1DQ5T752 114 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 AOC3Q16853 763 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 TREHO43280 583 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 CD96P40200 585 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.88□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 FAM168AQ92567 244 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 NTF4P34130 210 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM37O94972 964 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 PLCB3Q01970 1234 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 RING1Q06587 406 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 FBF1Q8TES7 1133 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 CBX8Q9HC52 389 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 SAMM50Q9Y512 469 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 ENC1O14682 589 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 BMP6P22004 513 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 GSTT1P30711 240 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 PPM1JQ5JR12 505 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 ASB11Q8WXH4 323 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 CEP44Q9C0F1 390 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 FANCGO15287 622 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 ITIH2P19823 946 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-202ENST00000368205 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRK-202ENST00000368205 MAPK1P28482 360 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC14Q15048 493 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-202ENST00000368205 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-202ENST00000368205 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms