RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF384Q8TF68 577 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 OTUD5Q96G74 571 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF341Q9BYN7 854 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 RAI14Q9P0K7 980 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 MYH1P12882 1939 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 HMMRO75330 724 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ENTPD3O75355 529 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 IDI2Q9BXS1 227 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 SNRKQ9NRH2 765 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 GPR25O00155 361 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 LDHCP07864 332 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 GTF2A2P52657 109 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PICALMQ13492 652 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PDE3AQ14432 1141 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ERO1BQ86YB8 467 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.38□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 INPP5BP32019 993 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ZAP70P43403 619 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 RHBDL3P58872 404 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PPIL2Q13356 520 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 CCL15Q16663 113 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 AACSQ86V21 672 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PTPN18Q99952 460 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.37□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 APBB1O00213 710 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 FKTNO75072 461 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 CRHR2Q13324 411 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 SNAPC2Q13487 334 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 TEX11Q8IYF3 940 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 KIF1BPQ96EK5 621 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF112Q9UJU3 913 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 MYH8P13535 1937 aa9.36□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 IRF6O14896 467 aa9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 MGAMO43451 1857 aa9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 IGSF3O75054 1194 aa9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 CETPP11597 493 aa9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PLCG2P16885 1265 aa9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PPATQ06203 517 aa9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 SPOCK2Q92563 424 aa9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.34□□□□□ -0.91
SGMS1-201ENST00000361543 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms