RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352068.5

SNX15-201, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SNX15, Length 771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-201ENST00000352068 A0A1B0GUL6 1792 aa15.61■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.6■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 KSR2Q6VAB6 950 aa15.6■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 PICK1Q9NRD5 415 aa15.6■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa15.6■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 PTPRFP10586 1907 aa15.59■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.59■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 GRIK5Q16478 980 aa15.59■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa15.59■□□□□ 0.09
SNX15-201ENST00000352068 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PTPRAP18433 802 aa15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CYP2B6P20813 491 aa15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PDE3AQ14432 1141 aa15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PPM1EQ8WY54 764 aa15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PLXNB2O15031 1838 aa15.58■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 BADQ92934 168 aa15.57■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CHMP4AQ9BY43 222 aa15.57■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 XIRP2A4UGR9 3374 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PLIN1O60240 522 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 GYG1P46976 350 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 RTP1P59025 263 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 UBE4AQ14139 1066 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 NEUROD2Q15784 382 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 ZNF576Q9H609 170 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 MAST3O60307 1309 aa15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.55■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 DNAJB2P25686 324 aa15.55■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.55■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CASP7P55210 303 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 TCP10Q12799 353 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 GCKRQ14397 625 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.54■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 TRIM75PA6NK02 468 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 TREML2Q5T2D2 321 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 MBIPQ9NS73 344 aa15.53■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 BMP1P13497 986 aa15.52■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 VPS37DQ86XT2 251 aa15.52■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.52■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.52■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.52■□□□□ 0.08
SNX15-201ENST00000352068 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.52■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 DNM1LO00429 736 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 MSCO60682 206 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 GPR37L1O60883 481 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 LPAR1Q92633 364 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 TIFAQ96CG3 184 aa15.51■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 REV3LO60673 3130 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 MRE11P49959 708 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 CHMP3Q9Y3E7 222 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 RLFQ13129 1914 aa15.5■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 RGS2P41220 211 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 NFIAQ12857 509 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 AAK1Q2M2I8 961 aa15.49■□□□□ 0.07
SNX15-201ENST00000352068 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms