RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 PFKFB1P16118 471 aa22.49■■□□□ 1.19
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TM7SF3-201ENST00000343028 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.48■■□□□ 1.19
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TM7SF3-201ENST00000343028 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.45■■□□□ 1.18
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TM7SF3-201ENST00000343028 KRT23Q9C075 422 aa22.44■■□□□ 1.18
TM7SF3-201ENST00000343028 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.44■■□□□ 1.18
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TM7SF3-201ENST00000343028 ERICH2A1L162 156 aa22.43■■□□□ 1.18
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TM7SF3-201ENST00000343028 CAVIN2O95810 425 aa22.42■■□□□ 1.18
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TM7SF3-201ENST00000343028 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.42■■□□□ 1.18
TM7SF3-201ENST00000343028 GRIN1Q05586 938 aa22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3-201ENST00000343028 PNOCQ13519 176 aa22.41■■□□□ 1.18
TM7SF3-201ENST00000343028 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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TM7SF3-201ENST00000343028 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3-201ENST00000343028 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TM7SF3-201ENST00000343028 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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TM7SF3-201ENST00000343028 PTPN21Q16825 1174 aa22.39■■□□□ 1.18
TM7SF3-201ENST00000343028 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.39■■□□□ 1.18
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