RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 MYO1BO43795 1136 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 SLU7O95391 586 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
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PTDSS1-201ENST00000337004 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.77■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 SERPINC1P01008 464 aa24.76■■□□□ 1.55
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PTDSS1-201ENST00000337004 MYL10Q9BUA6 226 aa24.76■■□□□ 1.55
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PTDSS1-201ENST00000337004 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.76■■□□□ 1.55
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PTDSS1-201ENST00000337004 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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PTDSS1-201ENST00000337004 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.73■■□□□ 1.55
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PTDSS1-201ENST00000337004 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTDSS1-201ENST00000337004 BTBD18B2RXH4 712 aa24.7■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 HOMER1Q86YM7 354 aa24.7■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 TMTC2Q8N394 836 aa24.7■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 DPF2Q92785 391 aa24.7■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 NID2Q14112 1375 aa24.7■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.69■■□□□ 1.54
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PTDSS1-201ENST00000337004 TDO2P48775 406 aa24.69■■□□□ 1.54
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PTDSS1-201ENST00000337004 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.69■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 VSTM4Q8IW00 320 aa24.69■■□□□ 1.54
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PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.69■■□□□ 1.54
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PTDSS1-201ENST00000337004 MTA3Q9BTC8 594 aa24.69■■□□□ 1.54
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PTDSS1-201ENST00000337004 BCL9O00512 1426 aa24.68■■□□□ 1.54
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PTDSS1-201ENST00000337004 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.68■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 TMX1Q9H3N1 280 aa24.68■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.68■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 DEXIO95424 95 aa24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 GUCY1A2P33402 732 aa24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPREP23469 700 aa24.67■■□□□ 1.54
PTDSS1-201ENST00000337004 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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