RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 FGRP09769 529 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 BTDP43251 543 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP2D6P10635 497 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 RHBDL3P58872 404 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CCT2P78371 535 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 AOC3Q16853 763 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT23Q9C075 422 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 BAG3O95817 575 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SBK1Q52WX2 424 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXW7Q969H0 707 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 LY9Q9HBG7 655 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 STX6O43752 255 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ECE2O60344 883 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 USP17L8P0C7I0 530 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 F8W031 263 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 FOCADQ5VW36 1801 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 NAV1Q8NEY1 1877 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM87BQ96K49 555 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 GBP4Q96PP9 640 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 G3V3G9 751 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PRDM1O75626 825 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 DACT2Q5SW24 774 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SGMS1Q86VZ5 419 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 MTMR6Q9Y217 621 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 COL4A5P29400 1685 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TGFB2P61812 414 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 STRIP1Q5VSL9 837 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TOMM22Q9NS69 142 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TCHHQ07283 1943 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 YDJCA8MPS7 323 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 LIFRP42702 1097 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 USP5P45974 858 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC93Q567U6 631 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM67Q5HYA8 995 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf60Q5U649 245 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA8BA8MQT2 603 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 POLD1P28340 1107 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SCNN1DP51172 638 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 APOA5Q6Q788 366 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SLF2Q8IX21 1173 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMD1Q99460 953 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 CERS3Q8IU89 383 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX11Q96FC9 970 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PSME4Q14997 1843 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIP5K2O43314 1243 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PPFIA3O75145 1194 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PLCD1P51178 756 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC23AQ15436 765 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ESR2Q92731 530 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 FLT1P17948 1338 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 MYH1P12882 1939 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPDC1A2A3K4 754 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ORC4O43929 436 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PTGER2P43116 358 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX11Q8IYF3 940 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 MTA3Q9BTC8 594 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 PIM2Q9P1W9 311 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 ROBO3Q96MS0 1386 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 USP17L3A6NCW0 530 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 USP17L4A6NCW7 530 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms