RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 KRT40Q6A162 431 aa14.93□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 IQUBQ8NA54 791 aa14.93□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.93□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.93□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.93□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 MYL10Q9BUA6 226 aa14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 A0A087WZG4 1122 aa14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 YY1AP1Q9H869 796 aa14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 DACH1Q9UI36 760 aa14.92□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 PPFIA4O75335 1185 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 HOXB7P09629 217 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 SIRT1Q96EB6 747 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 USP31Q70CQ4 1352 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 CASP14P31944 242 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 GCKRQ14397 625 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 POSTNQ15063 836 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 MAST3O60307 1309 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 M0R2C6 588 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 ABL1P00519 1130 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 PPARDQ03181 441 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 C3P01024 1663 aa14.91□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 PIP4K2BP78356 416 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 BMP6P22004 513 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 SAMM50Q9Y512 469 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 EBAG9O00559 213 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 CASP1P29466 404 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.9□□□□□ -0.02
ITGA3-201ENST00000007722 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 STIM1Q13586 685 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 MCTP2Q6DN12 878 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF213O14771 459 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 SRGAP2O75044 1071 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 NCOA7Q8NI08 942 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 MED4Q9NPJ6 270 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 MYO6Q9UM54 1294 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.89□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 CDC25AP30304 524 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 STAMQ92783 540 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 VPS16Q9H269 839 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 CENPHQ9H3R5 247 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 AGLP35573 1532 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 GRIN1Q05586 938 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 EHD4Q9H223 541 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 SHTN1A0MZ66 631 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 MAP2K2P36507 400 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 MAP9Q49MG5 647 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.88□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 N4BP3O15049 544 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 RESP18Q5W5W9 173 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.87□□□□□ -0.03
ITGA3-201ENST00000007722 OSBP2Q969R2 916 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms