RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
EFHC1-223	ENST00000636616	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
EFHC1-223	ENST00000636616	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFHC1-223	ENST00000636616	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFHC1-223	ENST00000636616	PKD2	Q13563	968 aa		10.42	□□□□□ -0.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NUBP1	P53384	320 aa		10.41	□□□□□ -0.74
EFHC1-223	ENST00000636616	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	10.4	□□□□□ -0.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
EFHC1-223	ENST00000636616	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GSE1	Q14687	1217 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
EFHC1-223	ENST00000636616	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RASEF	Q8IZ41	740 aa		10.33	□□□□□ -0.76
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.31	□□□□□ -0.76
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM41	Q8WV44	630 aa		10.27	□□□□□ -0.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.26	□□□□□ -0.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RGL2	O15211	777 aa		10.22	□□□□□ -0.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		10.21	□□□□□ -0.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PYGB	P11216	843 aa		10.16	□□□□□ -0.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.15	□□□□□ -0.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		10.15	□□□□□ -0.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		10.11	□□□□□ -0.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		10.08	□□□□□ -0.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
EFHC1-223	ENST00000636616	POTEJ	P0CG39	1038 aa		10.07	□□□□□ -0.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		10.05	□□□□□ -0.8
EFHC1-223	ENST00000636616	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.04	□□□□□ -0.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.03	□□□□□ -0.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K13	O43283	966 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	BCAN	Q96GW7	911 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF12	Q96QT6	1004 aa		10.02	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10.01	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		10	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	METRN	Q9UJH8	293 aa		9.98	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNL1	Q8IU54	200 aa		9.97	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	C7	P10643	843 aa		9.96	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC39A7	Q92504	469 aa		9.96	□□□□□ -0.81
EFHC1-223	ENST00000636616	STK25	O00506	426 aa		9.96	□□□□□ -0.82
EFHC1-223	ENST00000636616	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	9.94	□□□□□ -0.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PSEN1	P49768	467 aa		9.93	□□□□□ -0.82
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		9.93	□□□□□ -0.82
EFHC1-223	ENST00000636616	STK24	Q9Y6E0	443 aa		9.93	□□□□□ -0.82
EFHC1-223	ENST00000636616	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		9.91	□□□□□ -0.82
EFHC1-223	ENST00000636616	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	9.87	□□□□□ -0.83
EFHC1-223	ENST00000636616	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	9.86	□□□□□ -0.83
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP44	Q96MT7	982 aa		9.85	□□□□□ -0.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPC6	Q9Y210	931 aa		9.85	□□□□□ -0.83
EFHC1-223	ENST00000636616	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		9.85	□□□□□ -0.83
EFHC1-223	ENST00000636616	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		9.83	□□□□□ -0.84
EFHC1-223	ENST00000636616	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
EFHC1-223	ENST00000636616	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		9.82	□□□□□ -0.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		9.81	□□□□□ -0.84
EFHC1-223	ENST00000636616	TIE1	P35590	1138 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFHC1-223	ENST00000636616	CABP2	Q9NPB3	220 aa		9.8	□□□□□ -0.84
EFHC1-223	ENST00000636616	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
EFHC1-223	ENST00000636616	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		9.77	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	9.77	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		9.76	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	9.75	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	9.74	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX12	O15370	315 aa		9.73	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	MFRP	Q9BY79	579 aa		9.73	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	9.73	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA2	Q08379	1002 aa		9.72	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	ST18	O60284	1047 aa		9.71	□□□□□ -0.85
EFHC1-223	ENST00000636616	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		9.71	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		9.7	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	9.69	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRP6	P59044	892 aa		9.69	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	9.69	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		9.69	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		9.69	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		9.69	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		9.68	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		9.68	□□□□□ -0.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		9.63	□□□□□ -0.87

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