RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629212.2

PCBP1-AS1-341, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 827 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.87□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZMYND15Q9H091 742 aa10.86□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.85□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TRIM41Q8WV44 630 aa10.82□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 NEUROD2Q15784 382 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 P3H3Q8IVL6 736 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.78□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CAPN15O75808 1086 aa10.71□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa10.71□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 DSG3P32926 999 aa10.69□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ARID3AQ99856 593 aa10.67□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 MIER1Q8N108 512 aa10.66□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 POLA2Q14181 598 aa10.65□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PLEKHG5O94827 1062 aa10.62□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.61□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.55□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 GSE1Q14687 1217 aa10.53□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 WDR70Q9NW82 654 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 NECTIN2Q92692 538 aa10.49□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 APBB1O00213 710 aa10.48□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.47□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 POTEHQ6S545 545 aa10.46□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.46□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 STK25O00506 426 aa10.45□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.45□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.44□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SPDYE6P0CI01 402 aa10.44□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.44□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ABCB7O75027 752 aa10.43□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 RAD21O60216 631 aa10.42□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZMYND10O75800 440 aa10.39□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ARID3CA6NKF2 412 aa10.38□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 IGSF3O75054 1194 aa10.38□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.38□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TRAIPQ9BWF2 469 aa10.38□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 IL27Q8NEV9 243 aa10.37□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 FLIIQ13045 1269 aa10.36□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 RGS22Q8NE09 1264 aa10.34□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 AK7Q96M32 723 aa10.31□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.3□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.3□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 BARGINQ6ZT62 677 aa10.3□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 STK24Q9Y6E0 443 aa10.3□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 NUBP1P53384 320 aa10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.28□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 MTMR7Q9Y216 660 aa10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 A6NJR5 290 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 OSCARQ8IYS5 282 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 FAM212AQ96EL1 285 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 E9PSI1 815 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TRAK2O60296 914 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SEMA3EO15041 775 aa10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 E2F4Q16254 413 aa10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PDE4DQ08499 809 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms