RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627968.2

HIVEP1-209, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HIVEP1, Length 8,924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-209ENST00000627968 ARXQ96QS3 562 aa16.25■□□□□ 0.19
HIVEP1-209ENST00000627968 NACADO15069 1562 aa16.24■□□□□ 0.19
HIVEP1-209ENST00000627968 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
HIVEP1-209ENST00000627968 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HIVEP1-209ENST00000627968 CLIP1P30622 1438 aa16.22■□□□□ 0.19
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HIVEP1-209ENST00000627968 GGT6Q6P531 493 aa16.17■□□□□ 0.18
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HIVEP1-209ENST00000627968 SOX12O15370 315 aa16.14■□□□□ 0.17
HIVEP1-209ENST00000627968 KIF27Q86VH2 1401 aa16.13■□□□□ 0.17
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HIVEP1-209ENST00000627968 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
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HIVEP1-209ENST00000627968 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.1■□□□□ 0.17
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HIVEP1-209ENST00000627968 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1-209ENST00000627968 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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HIVEP1-209ENST00000627968 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.02■□□□□ 0.16
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HIVEP1-209ENST00000627968 GOLGA3Q08378 1498 aa16.02■□□□□ 0.15
HIVEP1-209ENST00000627968 CEP162Q5TB80 1403 aa16.01■□□□□ 0.15
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HIVEP1-209ENST00000627968 SOGA1O94964 1423 aa15.98■□□□□ 0.15
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HIVEP1-209ENST00000627968 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.97■□□□□ 0.15
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HIVEP1-209ENST00000627968 NPHP1O15259 732 aa15.93■□□□□ 0.14
HIVEP1-209ENST00000627968 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.92■□□□□ 0.14
HIVEP1-209ENST00000627968 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.91■□□□□ 0.14
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HIVEP1-209ENST00000627968 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.89■□□□□ 0.13
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HIVEP1-209ENST00000627968 NUTM2FA1L443 756 aa15.86■□□□□ 0.13
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HIVEP1-209ENST00000627968 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.81■□□□□ 0.12
HIVEP1-209ENST00000627968 CFAP53Q96M91 514 aa15.81■□□□□ 0.12
HIVEP1-209ENST00000627968 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
HIVEP1-209ENST00000627968 OSCARQ8IYS5 282 aa15.81■□□□□ 0.12
HIVEP1-209ENST00000627968 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HIVEP1-209ENST00000627968 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.8■□□□□ 0.12
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HIVEP1-209ENST00000627968 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
HIVEP1-209ENST00000627968 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.77■□□□□ 0.11
HIVEP1-209ENST00000627968 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.76■□□□□ 0.11
HIVEP1-209ENST00000627968 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.76■□□□□ 0.11
HIVEP1-209ENST00000627968 SMARCA2P51531 1590 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP1-209ENST00000627968 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP1-209ENST00000627968 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP1-209ENST00000627968 CDCA8Q53HL2 280 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP1-209ENST00000627968 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
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HIVEP1-209ENST00000627968 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
HIVEP1-209ENST00000627968 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.71■□□□□ 0.11
HIVEP1-209ENST00000627968 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.71■□□□□ 0.1
HIVEP1-209ENST00000627968 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
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HIVEP1-209ENST00000627968 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HIVEP1-209ENST00000627968 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.68■□□□□ 0.1
HIVEP1-209ENST00000627968 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HIVEP1-209ENST00000627968 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HIVEP1-209ENST00000627968 EID1Q9Y6B2 187 aa15.66■□□□□ 0.1
HIVEP1-209ENST00000627968 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.66■□□□□ 0.1
HIVEP1-209ENST00000627968 TMF1P82094 1093 aa15.65■□□□□ 0.1
HIVEP1-209ENST00000627968 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.65■□□□□ 0.1
HIVEP1-209ENST00000627968 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HIVEP1-209ENST00000627968 MORC1Q86VD1 984 aa15.63■□□□□ 0.09
HIVEP1-209ENST00000627968 NUP155O75694 1391 aa15.63■□□□□ 0.09
HIVEP1-209ENST00000627968 WIZO95785 1651 aa15.62■□□□□ 0.09
HIVEP1-209ENST00000627968 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.62■□□□□ 0.09
HIVEP1-209ENST00000627968 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HIVEP1-209ENST00000627968 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.6■□□□□ 0.09
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