RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
HERC3-212ENST00000597259 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
HERC3-212ENST00000597259 RASEFQ8IZ41 740 aa12.91□□□□□ -0.34
HERC3-212ENST00000597259 OTUD5Q96G74 571 aa12.91□□□□□ -0.34
HERC3-212ENST00000597259 PLEKHG5O94827 1062 aa12.89□□□□□ -0.35
HERC3-212ENST00000597259 KIF12Q96FN5 646 aa12.88□□□□□ -0.35
HERC3-212ENST00000597259 FKBP8Q14318 412 aa12.87□□□□□ -0.35
HERC3-212ENST00000597259 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-212ENST00000597259 METRNQ9UJH8 293 aa12.86□□□□□ -0.35
HERC3-212ENST00000597259 TRPC6Q9Y210 931 aa12.85□□□□□ -0.35
HERC3-212ENST00000597259 MAP3K13O43283 966 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-212ENST00000597259 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
HERC3-212ENST00000597259 SLC39A7Q92504 469 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-212ENST00000597259 POTEJP0CG39 1038 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-212ENST00000597259 C7P10643 843 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-212ENST00000597259 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HERC3-212ENST00000597259 NUBP1P53384 320 aa12.75□□□□□ -0.37
HERC3-212ENST00000597259 POTEFA5A3E0 1075 aa12.7□□□□□ -0.38
HERC3-212ENST00000597259 TIE1P35590 1138 aa12.7□□□□□ -0.38
HERC3-212ENST00000597259 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
HERC3-212ENST00000597259 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.66□□□□□ -0.38
HERC3-212ENST00000597259 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.66□□□□□ -0.38
HERC3-212ENST00000597259 FAM212AQ96EL1 285 aa12.63□□□□□ -0.39
HERC3-212ENST00000597259 IFNL1Q8IU54 200 aa12.61□□□□□ -0.39
HERC3-212ENST00000597259 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
HERC3-212ENST00000597259 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.6□□□□□ -0.39
HERC3-212ENST00000597259 MAMSTRQ6ZN01 415 aa12.59□□□□□ -0.39
HERC3-212ENST00000597259 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.59□□□□□ -0.39
HERC3-212ENST00000597259 POTEMA6NI47 508 aa12.57□□□□□ -0.4
HERC3-212ENST00000597259 PLSCR2Q9NRY7 297 aa12.56□□□□□ -0.4
HERC3-212ENST00000597259 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.55□□□□□ -0.4
HERC3-212ENST00000597259 SEC24BO95487 1268 aa12.54□□□□□ -0.4
HERC3-212ENST00000597259 POTEGQ6S5H5 508 aa12.54□□□□□ -0.4
HERC3-212ENST00000597259 FBXO3Q9UK99 471 aa12.53□□□□□ -0.4
HERC3-212ENST00000597259 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.52□□□□□ -0.41
HERC3-212ENST00000597259 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.52□□□□□ -0.41
HERC3-212ENST00000597259 PYGBP11216 843 aa12.51□□□□□ -0.41
HERC3-212ENST00000597259 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
HERC3-212ENST00000597259 IER5LQ5T953 404 aa12.49□□□□□ -0.41
HERC3-212ENST00000597259 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
HERC3-212ENST00000597259 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
HERC3-212ENST00000597259 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.44□□□□□ -0.42
HERC3-212ENST00000597259 KLHL34Q8N239 644 aa12.42□□□□□ -0.42
HERC3-212ENST00000597259 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
HERC3-212ENST00000597259 PLCG2P16885 1265 aa12.37□□□□□ -0.43
HERC3-212ENST00000597259 GSE1Q14687 1217 aa12.32□□□□□ -0.44
HERC3-212ENST00000597259 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.32□□□□□ -0.44
HERC3-212ENST00000597259 OCEL1Q9H607 264 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-212ENST00000597259 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
HERC3-212ENST00000597259 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
HERC3-212ENST00000597259 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-212ENST00000597259 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
HERC3-212ENST00000597259 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
HERC3-212ENST00000597259 ST18O60284 1047 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-212ENST00000597259 PSEN1P49768 467 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-212ENST00000597259 SPOCK2Q92563 424 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-212ENST00000597259 GOLGA2Q08379 1002 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-212ENST00000597259 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
HERC3-212ENST00000597259 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
HERC3-212ENST00000597259 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
HERC3-212ENST00000597259 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.13□□□□□ -0.47
HERC3-212ENST00000597259 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
HERC3-212ENST00000597259 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
HERC3-212ENST00000597259 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-212ENST00000597259 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.07□□□□□ -0.48
HERC3-212ENST00000597259 CABP2Q9NPB3 220 aa12.07□□□□□ -0.48
HERC3-212ENST00000597259 DPY19L2Q6NUT2 758 aa12.06□□□□□ -0.48
HERC3-212ENST00000597259 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
HERC3-212ENST00000597259 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
HERC3-212ENST00000597259 SNPHO15079 494 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-212ENST00000597259 MARVELD3Q96A59 401 aa12.03□□□□□ -0.48
HERC3-212ENST00000597259 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
HERC3-212ENST00000597259 ABCC9O60706 1549 aa11.97□□□□□ -0.49
HERC3-212ENST00000597259 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.93□□□□□ -0.5
HERC3-212ENST00000597259 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.92□□□□□ -0.5
HERC3-212ENST00000597259 TRIM41Q8WV44 630 aa11.91□□□□□ -0.5
HERC3-212ENST00000597259 EMP3P54852 163 aa11.9□□□□□ -0.5
HERC3-212ENST00000597259 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HERC3-212ENST00000597259 G3V3G9 751 aa11.88□□□□□ -0.51
HERC3-212ENST00000597259 POTEB3A0JP26 581 aa11.87□□□□□ -0.51
HERC3-212ENST00000597259 POTEBQ6S5H4 581 aa11.87□□□□□ -0.51
HERC3-212ENST00000597259 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HERC3-212ENST00000597259 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.85□□□□□ -0.51
HERC3-212ENST00000597259 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HERC3-212ENST00000597259 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
HERC3-212ENST00000597259 FAM205CA6NFA0 338 aa11.82□□□□□ -0.52
HERC3-212ENST00000597259 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
HERC3-212ENST00000597259 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.82□□□□□ -0.52
HERC3-212ENST00000597259 MMRN1Q13201 1228 aa11.81□□□□□ -0.52
HERC3-212ENST00000597259 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.78□□□□□ -0.52
HERC3-212ENST00000597259 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-212ENST00000597259 MICALL2Q8IY33 904 aa11.77□□□□□ -0.53
HERC3-212ENST00000597259 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HERC3-212ENST00000597259 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.76□□□□□ -0.53
HERC3-212ENST00000597259 SOX12O15370 315 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-212ENST00000597259 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.73□□□□□ -0.53
HERC3-212ENST00000597259 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HERC3-212ENST00000597259 DOK7Q18PE1 504 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms