RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A7	Q92504	469 aa		10.7	□□□□□ -0.7
AKAP13-223	ENST00000560957	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		10.7	□□□□□ -0.7
AKAP13-223	ENST00000560957	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		10.68	□□□□□ -0.7
AKAP13-223	ENST00000560957	POTEJ	P0CG39	1038 aa		10.65	□□□□□ -0.7
AKAP13-223	ENST00000560957	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.65	□□□□□ -0.7
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		10.58	□□□□□ -0.72
AKAP13-223	ENST00000560957	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
AKAP13-223	ENST00000560957	PROM2	Q8N271	834 aa		10.55	□□□□□ -0.72
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
AKAP13-223	ENST00000560957	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		10.55	□□□□□ -0.72
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.53	□□□□□ -0.72
AKAP13-223	ENST00000560957	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
AKAP13-223	ENST00000560957	POTEF	A5A3E0	1075 aa		10.48	□□□□□ -0.73
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
AKAP13-223	ENST00000560957	TIE1	P35590	1138 aa		10.47	□□□□□ -0.73
AKAP13-223	ENST00000560957	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		10.45	□□□□□ -0.74
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.44	□□□□□ -0.74
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP3K13	O43283	966 aa		10.42	□□□□□ -0.74
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.39	□□□□□ -0.75
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.38	□□□□□ -0.75
AKAP13-223	ENST00000560957	RASEF	Q8IZ41	740 aa		10.38	□□□□□ -0.75
AKAP13-223	ENST00000560957	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
AKAP13-223	ENST00000560957	IER5L	Q5T953	404 aa		10.36	□□□□□ -0.75
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC24B	O95487	1268 aa		10.35	□□□□□ -0.75
AKAP13-223	ENST00000560957	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		10.35	□□□□□ -0.75
AKAP13-223	ENST00000560957	MIER1	Q8N108	512 aa		10.33	□□□□□ -0.76
AKAP13-223	ENST00000560957	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.3	□□□□□ -0.76
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		10.3	□□□□□ -0.76
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10.27	□□□□□ -0.77
AKAP13-223	ENST00000560957	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.23	□□□□□ -0.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ST18	O60284	1047 aa		10.22	□□□□□ -0.77
AKAP13-223	ENST00000560957	NUBP1	P53384	320 aa		10.21	□□□□□ -0.77
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNL1	Q8IU54	200 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		10.2	□□□□□ -0.78
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		10.18	□□□□□ -0.78
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCG2	P16885	1265 aa		10.17	□□□□□ -0.78
AKAP13-223	ENST00000560957	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
AKAP13-223	ENST00000560957	OCEL1	Q9H607	264 aa		10.09	□□□□□ -0.79
AKAP13-223	ENST00000560957	SNPH	O15079	494 aa		10.08	□□□□□ -0.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.08	□□□□□ -0.8
AKAP13-223	ENST00000560957	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.07	□□□□□ -0.8
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
AKAP13-223	ENST00000560957	MARVELD3	Q96A59	401 aa		9.98	□□□□□ -0.81
AKAP13-223	ENST00000560957	PYGB	P11216	843 aa		9.97	□□□□□ -0.81
AKAP13-223	ENST00000560957	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		9.96	□□□□□ -0.82
AKAP13-223	ENST00000560957	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		9.95	□□□□□ -0.82
AKAP13-223	ENST00000560957	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		9.91	□□□□□ -0.82
AKAP13-223	ENST00000560957	EMP3	P54852	163 aa		9.9	□□□□□ -0.82
AKAP13-223	ENST00000560957	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	9.9	□□□□□ -0.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	9.88	□□□□□ -0.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		9.87	□□□□□ -0.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		9.87	□□□□□ -0.83
AKAP13-223	ENST00000560957	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	9.86	□□□□□ -0.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA2	Q08379	1002 aa		9.85	□□□□□ -0.83
AKAP13-223	ENST00000560957	FKBP8	Q14318	412 aa		9.85	□□□□□ -0.83
AKAP13-223	ENST00000560957	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		9.85	□□□□□ -0.83
AKAP13-223	ENST00000560957	POTEB3	A0JP26	581 aa		9.84	□□□□□ -0.83
AKAP13-223	ENST00000560957	POTEB	Q6S5H4	581 aa		9.84	□□□□□ -0.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GSE1	Q14687	1217 aa		9.83	□□□□□ -0.84
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
AKAP13-223	ENST00000560957	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
AKAP13-223	ENST00000560957	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	9.82	□□□□□ -0.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO3	Q9UK99	471 aa		9.82	□□□□□ -0.84
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM205C	A6NFA0	338 aa		9.81	□□□□□ -0.84
AKAP13-223	ENST00000560957	PSEN1	P49768	467 aa		9.78	□□□□□ -0.84
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	9.73	□□□□□ -0.85
AKAP13-223	ENST00000560957	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	9.72	□□□□□ -0.85
AKAP13-223	ENST00000560957	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		9.71	□□□□□ -0.86
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL34	Q8N239	644 aa		9.71	□□□□□ -0.86
AKAP13-223	ENST00000560957	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	9.7	□□□□□ -0.86
AKAP13-223	ENST00000560957	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		9.7	□□□□□ -0.86
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	9.69	□□□□□ -0.86
AKAP13-223	ENST00000560957		G3V3G9	751 aa		9.67	□□□□□ -0.86
AKAP13-223	ENST00000560957	DOK7	Q18PE1	504 aa		9.65	□□□□□ -0.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		9.65	□□□□□ -0.86
AKAP13-223	ENST00000560957	CABP2	Q9NPB3	220 aa		9.65	□□□□□ -0.86
AKAP13-223	ENST00000560957	ERBB3	P21860	1342 aa		9.62	□□□□□ -0.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	9.61	□□□□□ -0.87
AKAP13-223	ENST00000560957	RIMBP2	O15034	1052 aa		9.59	□□□□□ -0.87
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		9.56	□□□□□ -0.88
AKAP13-223	ENST00000560957	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	9.55	□□□□□ -0.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		9.55	□□□□□ -0.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SPOCK2	Q92563	424 aa		9.54	□□□□□ -0.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		9.53	□□□□□ -0.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	9.52	□□□□□ -0.89
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGER2	P43116	358 aa		9.51	□□□□□ -0.89
AKAP13-223	ENST00000560957	MICALL2	Q8IY33	904 aa		9.49	□□□□□ -0.89
AKAP13-223	ENST00000560957	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		9.49	□□□□□ -0.89
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR153	Q6NV75	609 aa		9.48	□□□□□ -0.89
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		9.48	□□□□□ -0.89
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM41	Q8WV44	630 aa		9.45	□□□□□ -0.9
AKAP13-223	ENST00000560957	SOX12	O15370	315 aa		9.41	□□□□□ -0.9
AKAP13-223	ENST00000560957	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		9.38	□□□□□ -0.91

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