RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545023.1

PTPRO-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, human

TSL 5

Gene PTPRO, Length 512 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRO-212	ENST00000545023	METRN	Q9UJH8	293 aa		14.67	□□□□□ -0.06
PTPRO-212	ENST00000545023	PLEKHG5	O94827	1062 aa		14.66	□□□□□ -0.06
PTPRO-212	ENST00000545023	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
PTPRO-212	ENST00000545023	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
PTPRO-212	ENST00000545023	PROM2	Q8N271	834 aa		14.64	□□□□□ -0.07
PTPRO-212	ENST00000545023	POTEM	A6NI47	508 aa		14.6	□□□□□ -0.07
PTPRO-212	ENST00000545023	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
PTPRO-212	ENST00000545023	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		14.59	□□□□□ -0.07
PTPRO-212	ENST00000545023	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		14.56	□□□□□ -0.08
PTPRO-212	ENST00000545023	POTEG	Q6S5H5	508 aa		14.55	□□□□□ -0.08
PTPRO-212	ENST00000545023	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PTPRO-212	ENST00000545023	KIF12	Q96FN5	646 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PTPRO-212	ENST00000545023	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	14.46	□□□□□ -0.09
PTPRO-212	ENST00000545023	MIER1	Q8N108	512 aa		14.46	□□□□□ -0.09
PTPRO-212	ENST00000545023	TIE1	P35590	1138 aa		14.45	□□□□□ -0.1
PTPRO-212	ENST00000545023	POTEJ	P0CG39	1038 aa		14.41	□□□□□ -0.1
PTPRO-212	ENST00000545023	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	14.4	□□□□□ -0.1
PTPRO-212	ENST00000545023	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	14.39	□□□□□ -0.11
PTPRO-212	ENST00000545023	MAP3K13	O43283	966 aa		14.37	□□□□□ -0.11
PTPRO-212	ENST00000545023	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		14.37	□□□□□ -0.11
PTPRO-212	ENST00000545023	SEC24B	O95487	1268 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPRO-212	ENST00000545023	RASEF	Q8IZ41	740 aa		14.33	□□□□□ -0.12
PTPRO-212	ENST00000545023	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		14.32	□□□□□ -0.12
PTPRO-212	ENST00000545023	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
PTPRO-212	ENST00000545023	IER5L	Q5T953	404 aa		14.31	□□□□□ -0.12
PTPRO-212	ENST00000545023	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		14.28	□□□□□ -0.12
PTPRO-212	ENST00000545023	TRPC6	Q9Y210	931 aa		14.26	□□□□□ -0.13
PTPRO-212	ENST00000545023	POTEF	A5A3E0	1075 aa		14.25	□□□□□ -0.13
PTPRO-212	ENST00000545023	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		14.23	□□□□□ -0.13
PTPRO-212	ENST00000545023	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	14.21	□□□□□ -0.13
PTPRO-212	ENST00000545023	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		14.2	□□□□□ -0.14
PTPRO-212	ENST00000545023	FAM212A	Q96EL1	285 aa		14.18	□□□□□ -0.14
PTPRO-212	ENST00000545023	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
PTPRO-212	ENST00000545023	NUBP1	P53384	320 aa		14.13	□□□□□ -0.15
PTPRO-212	ENST00000545023	PLCG2	P16885	1265 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPRO-212	ENST00000545023	IFNL1	Q8IU54	200 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPRO-212	ENST00000545023	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PTPRO-212	ENST00000545023	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PTPRO-212	ENST00000545023	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PTPRO-212	ENST00000545023	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPRO-212	ENST00000545023	SNPH	O15079	494 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPRO-212	ENST00000545023	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPRO-212	ENST00000545023	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
PTPRO-212	ENST00000545023	ST18	O60284	1047 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRO-212	ENST00000545023	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PTPRO-212	ENST00000545023	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PTPRO-212	ENST00000545023	FKBP8	Q14318	412 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPRO-212	ENST00000545023	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPRO-212	ENST00000545023	PYGB	P11216	843 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PTPRO-212	ENST00000545023	GSE1	Q14687	1217 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPRO-212	ENST00000545023	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPRO-212	ENST00000545023	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPRO-212	ENST00000545023	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRO-212	ENST00000545023	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRO-212	ENST00000545023	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRO-212	ENST00000545023	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRO-212	ENST00000545023	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRO-212	ENST00000545023	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRO-212	ENST00000545023	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PTPRO-212	ENST00000545023	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PTPRO-212	ENST00000545023	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PTPRO-212	ENST00000545023	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.64	□□□□□ -0.23
PTPRO-212	ENST00000545023	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRO-212	ENST00000545023	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRO-212	ENST00000545023	EMP3	P54852	163 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRO-212	ENST00000545023	PSEN1	P49768	467 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRO-212	ENST00000545023		G3V3G9	751 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRO-212	ENST00000545023	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRO-212	ENST00000545023	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRO-212	ENST00000545023	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRO-212	ENST00000545023	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRO-212	ENST00000545023	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRO-212	ENST00000545023	SPOCK2	Q92563	424 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRO-212	ENST00000545023	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRO-212	ENST00000545023	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRO-212	ENST00000545023	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRO-212	ENST00000545023	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRO-212	ENST00000545023	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRO-212	ENST00000545023	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPRO-212	ENST00000545023	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPRO-212	ENST00000545023	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPRO-212	ENST00000545023	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPRO-212	ENST00000545023	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PTPRO-212	ENST00000545023	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PTPRO-212	ENST00000545023	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PTPRO-212	ENST00000545023	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
PTPRO-212	ENST00000545023	ERBB3	P21860	1342 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PTPRO-212	ENST00000545023	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
PTPRO-212	ENST00000545023	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PTPRO-212	ENST00000545023	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPRO-212	ENST00000545023	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPRO-212	ENST00000545023	SOX12	O15370	315 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPRO-212	ENST00000545023	PTGER2	P43116	358 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PTPRO-212	ENST00000545023	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PTPRO-212	ENST00000545023	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PTPRO-212	ENST00000545023	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PTPRO-212	ENST00000545023	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PTPRO-212	ENST00000545023	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PTPRO-212	ENST00000545023	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PTPRO-212	ENST00000545023	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32

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