RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-214ENST00000530727 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRC-214ENST00000530727 PHF12Q96QT6 1004 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRC-214ENST00000530727 PYGBP11216 843 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRC-214ENST00000530727 CLCN6P51797 869 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRC-214ENST00000530727 GABBR2O75899 941 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRC-214ENST00000530727 KIF12Q96FN5 646 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K13O43283 966 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM41Q8WV44 630 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRC-214ENST00000530727 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRC-214ENST00000530727 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRC-214ENST00000530727 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PTPRC-214ENST00000530727 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRC-214ENST00000530727 PKD2Q13563 968 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRC-214ENST00000530727 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRC-214ENST00000530727 IFNL1Q8IU54 200 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRC-214ENST00000530727 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRC-214ENST00000530727 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRC-214ENST00000530727 TRPC6Q9Y210 931 aa9.99□□□□□ -0.81
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PTPRC-214ENST00000530727 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
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PTPRC-214ENST00000530727 TIE1P35590 1138 aa9.95□□□□□ -0.82
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PTPRC-214ENST00000530727 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-214ENST00000530727 POTEIP0CG38 1075 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-214ENST00000530727 PSEN1P49768 467 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-214ENST00000530727 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-214ENST00000530727 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-214ENST00000530727 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-214ENST00000530727 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-214ENST00000530727 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRC-214ENST00000530727 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-214ENST00000530727 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
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PTPRC-214ENST00000530727 STK25O00506 426 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRC-214ENST00000530727 SLC39A7Q92504 469 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRC-214ENST00000530727 CABP2Q9NPB3 220 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRC-214ENST00000530727 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRC-214ENST00000530727 STK24Q9Y6E0 443 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRC-214ENST00000530727 METRNQ9UJH8 293 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRC-214ENST00000530727 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-214ENST00000530727 IER5LQ5T953 404 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRC-214ENST00000530727 SEC24BO95487 1268 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRC-214ENST00000530727 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-214ENST00000530727 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRC-214ENST00000530727 PLCG2P16885 1265 aa9.71□□□□□ -0.86
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PTPRC-214ENST00000530727 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRC-214ENST00000530727 OCEL1Q9H607 264 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-214ENST00000530727 SOX12O15370 315 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRC-214ENST00000530727 POTEFA5A3E0 1075 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRC-214ENST00000530727 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 NLRP6P59044 892 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 LHX8Q68G74 356 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 MFRPQ9BY79 579 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 POTEB2H3BUK9 544 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRC-214ENST00000530727 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 G3V3G9 751 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 POTEJP0CG39 1038 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-214ENST00000530727 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRC-214ENST00000530727 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRC-214ENST00000530727 MICALL2Q8IY33 904 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R37O75864 691 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-214ENST00000530727 OTUD5Q96G74 571 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-214ENST00000530727 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRC-214ENST00000530727 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRC-214ENST00000530727 CFAP44Q96MT7 982 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRC-214ENST00000530727 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRC-214ENST00000530727 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRC-214ENST00000530727 TMC2Q8TDI7 906 aa9.33□□□□□ -0.92
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