RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRPC6Q9Y210 931 aa5.22□□□□□ -1.57
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEFA5A3E0 1075 aa5.21□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 METRNQ9UJH8 293 aa5.2□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.2□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEMA6NI47 508 aa5.19□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEGQ6S5H5 508 aa5.17□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF12Q96FN5 646 aa5.17□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RASEFQ8IZ41 740 aa5.16□□□□□ -1.58
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C7P10643 843 aa5.15□□□□□ -1.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC39A7Q92504 469 aa5.15□□□□□ -1.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP3K13O43283 966 aa5.13□□□□□ -1.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTLL13PA6NNM8 815 aa5.09□□□□□ -1.59
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIE1P35590 1138 aa5.08□□□□□ -1.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUBP1P53384 320 aa5.07□□□□□ -1.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MIER1Q8N108 512 aa5.06□□□□□ -1.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAMSTRQ6ZN01 415 aa5.05□□□□□ -1.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCUBE2Q9NQ36 999 aa5.05□□□□□ -1.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.05□□□□□ -1.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNL1Q8IU54 200 aa5.04□□□□□ -1.6
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa5.02□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.01□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC24BO95487 1268 aa4.99□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IER5LQ5T953 404 aa4.99□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLCD3Q8N3E9 789 aa4.99□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SGIP1Q9BQI5 828 aa4.99□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST18O60284 1047 aa4.98□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM106CQ9BVX2 250 aa4.98□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.97□□□□□ -1.61
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLAIN1Q8ND83 568 aa4.96□□□□□ -1.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLEKHG5O94827 1062 aa4.95□□□□□ -1.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PYGBP11216 843 aa4.94□□□□□ -1.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FKBP8Q14318 412 aa4.94□□□□□ -1.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.94□□□□□ -1.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLCG2P16885 1265 aa4.93□□□□□ -1.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM212AQ96EL1 285 aa4.93□□□□□ -1.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEB3A0JP26 581 aa4.9□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEBQ6S5H4 581 aa4.9□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OCEL1Q9H607 264 aa4.9□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MARVELD3Q96A59 401 aa4.89□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCAF8Q5TAQ9 597 aa4.88□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMRN1Q13201 1228 aa4.87□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPNS2Q8IVW8 549 aa4.87□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.84□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.84□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.84□□□□□ -1.63
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VASPP50552 380 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PSEN1P49768 467 aa4.81□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.79□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNPHO15079 494 aa4.78□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EMP3P54852 163 aa4.78□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSE1Q14687 1217 aa4.78□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C3orf67Q6ZVT6 689 aa4.78□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM205CA6NFA0 338 aa4.77□□□□□ -1.65
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHL34Q8N239 644 aa4.77□□□□□ -1.65
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXO3Q9UK99 471 aa4.77□□□□□ -1.65
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CABP2Q9NPB3 220 aa4.75□□□□□ -1.65
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGA2Q08379 1002 aa4.74□□□□□ -1.65
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.74□□□□□ -1.65
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BOLA1Q9Y3E2 137 aa4.73□□□□□ -1.65
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EFCAB3Q8N7B9 438 aa4.71□□□□□ -1.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPOCK2Q92563 424 aa4.7□□□□□ -1.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MS4A4AQ96JQ5 239 aa4.7□□□□□ -1.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MICALL2Q8IY33 904 aa4.67□□□□□ -1.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERBB3P21860 1342 aa4.66□□□□□ -1.66
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR153Q6NV75 609 aa4.65□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DOK7Q18PE1 504 aa4.64□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.64□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHF8Q9UPP1 1060 aa4.64□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 G3V3G9 751 aa4.61□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARSIQ5FYB1 569 aa4.61□□□□□ -1.67
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 POTEEQ6S8J3 1075 aa4.61□□□□□ -1.67
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