RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU6-677P-201ENST00000516914 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RNU6-677P-201ENST00000516914 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-677P-201ENST00000516914 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RNU6-677P-201ENST00000516914 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
RNU6-677P-201ENST00000516914 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-677P-201ENST00000516914 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RNU6-677P-201ENST00000516914 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-677P-201ENST00000516914 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RNU6-677P-201ENST00000516914 PYGBP11216 843 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-677P-201ENST00000516914 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RNU6-677P-201ENST00000516914 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RNU6-677P-201ENST00000516914 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-677P-201ENST00000516914 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 CFAP44Q96MT7 982 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 STK25O00506 426 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-677P-201ENST00000516914 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 STK24Q9Y6E0 443 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 KIF12Q96FN5 646 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAP3K13O43283 966 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-677P-201ENST00000516914 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU6-677P-201ENST00000516914 IFNL1Q8IU54 200 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-677P-201ENST00000516914 PSEN1P49768 467 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-677P-201ENST00000516914 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-677P-201ENST00000516914 PHF12Q96QT6 1004 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-677P-201ENST00000516914 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-677P-201ENST00000516914 MFRPQ9BY79 579 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-677P-201ENST00000516914 BCANQ96GW7 911 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-677P-201ENST00000516914 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRPC6Q9Y210 931 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-677P-201ENST00000516914 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 CABP2Q9NPB3 220 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 SOX12O15370 315 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP1R37O75864 691 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 NLRP6P59044 892 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 TIE1P35590 1138 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 EVX2Q03828 476 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 HAX1O00165 279 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 CLCN6P51797 869 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 GOLGA2Q08379 1002 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 NBR1Q14596 966 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 P3H3Q8IVL6 736 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 MFSD10Q14728 455 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 WDR70Q9NW82 654 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 GABBR2O75899 941 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEHQ6S545 545 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 IER5LQ5T953 404 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 PDE4AP27815 886 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 E2F4Q16254 413 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-677P-201ENST00000516914 MICALL2Q8IY33 904 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 OCEL1Q9H607 264 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 CAMK2BQ13554 666 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-677P-201ENST00000516914 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms