RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516454.1

RNU6-659P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 659, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-659P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-659P-201ENST00000516454 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RNU6-659P-201ENST00000516454 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-659P-201ENST00000516454 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RNU6-659P-201ENST00000516454 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-659P-201ENST00000516454 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-659P-201ENST00000516454 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-659P-201ENST00000516454 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-659P-201ENST00000516454 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-659P-201ENST00000516454 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-659P-201ENST00000516454 POTEFA5A3E0 1075 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-659P-201ENST00000516454 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-659P-201ENST00000516454 MMRN1Q13201 1228 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-659P-201ENST00000516454 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU6-659P-201ENST00000516454 SEC24BO95487 1268 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-659P-201ENST00000516454 ST18O60284 1047 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-659P-201ENST00000516454 TRPC6Q9Y210 931 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-659P-201ENST00000516454 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-659P-201ENST00000516454 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-659P-201ENST00000516454 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-659P-201ENST00000516454 KIF12Q96FN5 646 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-659P-201ENST00000516454 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-659P-201ENST00000516454 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-659P-201ENST00000516454 TIE1P35590 1138 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-659P-201ENST00000516454 MAP3K13O43283 966 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-659P-201ENST00000516454 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-659P-201ENST00000516454 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-659P-201ENST00000516454 IER5LQ5T953 404 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-659P-201ENST00000516454 MARVELD3Q96A59 401 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-659P-201ENST00000516454 PLCG2P16885 1265 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-659P-201ENST00000516454 RASEFQ8IZ41 740 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-659P-201ENST00000516454 SNPHO15079 494 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-659P-201ENST00000516454 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-659P-201ENST00000516454 EMP3P54852 163 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 PLEKHG5O94827 1062 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 IFNL1Q8IU54 200 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 MIER1Q8N108 512 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 POTEB3A0JP26 581 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM205CA6NFA0 338 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 POTEBQ6S5H4 581 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 OCEL1Q9H607 264 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-659P-201ENST00000516454 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-659P-201ENST00000516454 PROM2Q8N271 834 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-659P-201ENST00000516454 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-659P-201ENST00000516454 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-659P-201ENST00000516454 NUBP1P53384 320 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-659P-201ENST00000516454 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM212AQ96EL1 285 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-659P-201ENST00000516454 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-659P-201ENST00000516454 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-659P-201ENST00000516454 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-659P-201ENST00000516454 PYGBP11216 843 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-659P-201ENST00000516454 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-659P-201ENST00000516454 ERBB3P21860 1342 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-659P-201ENST00000516454 GOLGA2Q08379 1002 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-659P-201ENST00000516454 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-659P-201ENST00000516454 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-659P-201ENST00000516454 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-659P-201ENST00000516454 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-659P-201ENST00000516454 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-659P-201ENST00000516454 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-659P-201ENST00000516454 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-659P-201ENST00000516454 G3V3G9 751 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-659P-201ENST00000516454 DOK7Q18PE1 504 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-659P-201ENST00000516454 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 PTGER2P43116 358 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 RIMBP2O15034 1052 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 PSEN1P49768 467 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-659P-201ENST00000516454 CABP2Q9NPB3 220 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-659P-201ENST00000516454 GSE1Q14687 1217 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-659P-201ENST00000516454 GPR153Q6NV75 609 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 ARSIQ5FYB1 569 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 HCSTQ9UBK5 93 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 KLHL34Q8N239 644 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-659P-201ENST00000516454 MICALL2Q8IY33 904 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-659P-201ENST00000516454 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-659P-201ENST00000516454 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-659P-201ENST00000516454 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms