RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 METRNQ9UJH8 293 aa7.53□□□□□ -1.2
PDE4D-211ENST00000504624 C7P10643 843 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-211ENST00000504624 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-211ENST00000504624 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-211ENST00000504624 OTUD5Q96G74 571 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-211ENST00000504624 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-211ENST00000504624 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-211ENST00000504624 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-211ENST00000504624 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-211ENST00000504624 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-211ENST00000504624 POTEB2H3BUK9 544 aa7.46□□□□□ -1.22
PDE4D-211ENST00000504624 KIF12Q96FN5 646 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-211ENST00000504624 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-211ENST00000504624 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-211ENST00000504624 RASEFQ8IZ41 740 aa7.43□□□□□ -1.22
PDE4D-211ENST00000504624 MAP3K13O43283 966 aa7.42□□□□□ -1.22
PDE4D-211ENST00000504624 SEC24BO95487 1268 aa7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-211ENST00000504624 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PDE4D-211ENST00000504624 POTEMA6NI47 508 aa7.4□□□□□ -1.22
PDE4D-211ENST00000504624 TIE1P35590 1138 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-211ENST00000504624 FAM212AQ96EL1 285 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.39□□□□□ -1.23
PDE4D-211ENST00000504624 POTEGQ6S5H5 508 aa7.38□□□□□ -1.23
PDE4D-211ENST00000504624 TRPC6Q9Y210 931 aa7.36□□□□□ -1.23
PDE4D-211ENST00000504624 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-211ENST00000504624 FBXO3Q9UK99 471 aa7.35□□□□□ -1.23
PDE4D-211ENST00000504624 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-211ENST00000504624 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.34□□□□□ -1.23
PDE4D-211ENST00000504624 POTEJP0CG39 1038 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 NUBP1P53384 320 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 IER5LQ5T953 404 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 KLHL34Q8N239 644 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 PLCG2P16885 1265 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 IFNL1Q8IU54 200 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-211ENST00000504624 POTEFA5A3E0 1075 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-211ENST00000504624 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-211ENST00000504624 PYGBP11216 843 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-211ENST00000504624 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-211ENST00000504624 GOLGA2Q08379 1002 aa7.22□□□□□ -1.25
PDE4D-211ENST00000504624 GSE1Q14687 1217 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-211ENST00000504624 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-211ENST00000504624 OCEL1Q9H607 264 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-211ENST00000504624 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-211ENST00000504624 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-211ENST00000504624 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-211ENST00000504624 SPOCK2Q92563 424 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-211ENST00000504624 SNPHO15079 494 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-211ENST00000504624 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-211ENST00000504624 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-211ENST00000504624 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-211ENST00000504624 ST18O60284 1047 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-211ENST00000504624 G3V3G9 751 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-211ENST00000504624 PSEN1P49768 467 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-211ENST00000504624 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-211ENST00000504624 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-211ENST00000504624 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
PDE4D-211ENST00000504624 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-211ENST00000504624 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-211ENST00000504624 EMP3P54852 163 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE4D-211ENST00000504624 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PDE4D-211ENST00000504624 MARVELD3Q96A59 401 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE4D-211ENST00000504624 CABP2Q9NPB3 220 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4D-211ENST00000504624 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-211ENST00000504624 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM41Q8WV44 630 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 FAM205CA6NFA0 338 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 MMRN1Q13201 1228 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.92□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 PKD2Q13563 968 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 RIMBP2O15034 1052 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 DOK7Q18PE1 504 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-211ENST00000504624 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-211ENST00000504624 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-211ENST00000504624 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-211ENST00000504624 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4D-211ENST00000504624 ERBB3P21860 1342 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-211ENST00000504624 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-211ENST00000504624 RGL2O15211 777 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-211ENST00000504624 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PDE4D-211ENST00000504624 VGFO15240 615 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 SOX12O15370 315 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 MICALL2Q8IY33 904 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 POTEB3A0JP26 581 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-211ENST00000504624 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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