RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HULC-201ENST00000503668 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.93□□□□□ -0.02
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HULC-201ENST00000503668 SCRIBQ14160 1630 aa14.79□□□□□ -0.04
HULC-201ENST00000503668 PLCG2P16885 1265 aa14.78□□□□□ -0.04
HULC-201ENST00000503668 TRIM41Q8WV44 630 aa14.75□□□□□ -0.05
HULC-201ENST00000503668 OCEL1Q9H607 264 aa14.75□□□□□ -0.05
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HULC-201ENST00000503668 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.71□□□□□ -0.05
HULC-201ENST00000503668 SPOCK2Q92563 424 aa14.71□□□□□ -0.05
HULC-201ENST00000503668 PSEN1P49768 467 aa14.65□□□□□ -0.06
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HULC-201ENST00000503668 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.63□□□□□ -0.07
HULC-201ENST00000503668 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HULC-201ENST00000503668 ST18O60284 1047 aa14.59□□□□□ -0.07
HULC-201ENST00000503668 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HULC-201ENST00000503668 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HULC-201ENST00000503668 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HULC-201ENST00000503668 GOLGA2Q08379 1002 aa14.54□□□□□ -0.08
HULC-201ENST00000503668 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
HULC-201ENST00000503668 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.54□□□□□ -0.08
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HULC-201ENST00000503668 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HULC-201ENST00000503668 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.51□□□□□ -0.09
HULC-201ENST00000503668 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.5□□□□□ -0.09
HULC-201ENST00000503668 CABP2Q9NPB3 220 aa14.48□□□□□ -0.09
HULC-201ENST00000503668 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.47□□□□□ -0.09
HULC-201ENST00000503668 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HULC-201ENST00000503668 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HULC-201ENST00000503668 EEA1Q15075 1411 aa14.44□□□□□ -0.1
HULC-201ENST00000503668 WIZO95785 1651 aa14.44□□□□□ -0.1
HULC-201ENST00000503668 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.42□□□□□ -0.1
HULC-201ENST00000503668 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
HULC-201ENST00000503668 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.39□□□□□ -0.11
HULC-201ENST00000503668 SNPHO15079 494 aa14.37□□□□□ -0.11
HULC-201ENST00000503668 MARVELD3Q96A59 401 aa14.35□□□□□ -0.11
HULC-201ENST00000503668 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.34□□□□□ -0.11
HULC-201ENST00000503668 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
HULC-201ENST00000503668 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
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