RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-211ENST00000492895 PHF12Q96QT6 1004 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.89□□□□□ -0.99
ANKRD28-211ENST00000492895 GABBR2O75899 941 aa8.88□□□□□ -0.99
ANKRD28-211ENST00000492895 CLCN6P51797 869 aa8.87□□□□□ -0.99
ANKRD28-211ENST00000492895 GSE1Q14687 1217 aa8.85□□□□□ -0.99
ANKRD28-211ENST00000492895 KIF12Q96FN5 646 aa8.82□□□□□ -1
ANKRD28-211ENST00000492895 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
ANKRD28-211ENST00000492895 MAP3K13O43283 966 aa8.79□□□□□ -1
ANKRD28-211ENST00000492895 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
ANKRD28-211ENST00000492895 PYGBP11216 843 aa8.78□□□□□ -1
ANKRD28-211ENST00000492895 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD28-211ENST00000492895 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-211ENST00000492895 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-211ENST00000492895 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD28-211ENST00000492895 IFNL1Q8IU54 200 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM41Q8WV44 630 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-211ENST00000492895 POTEIP0CG38 1075 aa8.68□□□□□ -1.02
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.68□□□□□ -1.02
ANKRD28-211ENST00000492895 TRPC6Q9Y210 931 aa8.68□□□□□ -1.02
ANKRD28-211ENST00000492895 PKD2Q13563 968 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ANKRD28-211ENST00000492895 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TIE1P35590 1138 aa8.64□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.61□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.6□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ANKRD28-211ENST00000492895 PSEN1P49768 467 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD28-211ENST00000492895 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ANKRD28-211ENST00000492895 RGL2O15211 777 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD28-211ENST00000492895 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ANKRD28-211ENST00000492895 C7P10643 843 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC39A7Q92504 469 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD28-211ENST00000492895 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD28-211ENST00000492895 METRNQ9UJH8 293 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD28-211ENST00000492895 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-211ENST00000492895 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-211ENST00000492895 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD28-211ENST00000492895 GOLGA2Q08379 1002 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD28-211ENST00000492895 IER5LQ5T953 404 aa8.48□□□□□ -1.05
ANKRD28-211ENST00000492895 CABP2Q9NPB3 220 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-211ENST00000492895 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD28-211ENST00000492895 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 SEC24BO95487 1268 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 POTEFA5A3E0 1075 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 STK25O00506 426 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 LHX8Q68G74 356 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 STK24Q9Y6E0 443 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 POTEB2H3BUK9 544 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 PLCG2P16885 1265 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 OCEL1Q9H607 264 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-211ENST00000492895 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.069e-7■■□□□ 14.3
ANKRD28-211ENST00000492895 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-211ENST00000492895 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ANKRD28-211ENST00000492895 SOX12O15370 315 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-211ENST00000492895 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-211ENST00000492895 POTEJP0CG39 1038 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-211ENST00000492895 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-211ENST00000492895 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-211ENST00000492895 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 NLRP6P59044 892 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 OTUD5Q96G74 571 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 MFRPQ9BY79 579 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD28-211ENST00000492895 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD28-211ENST00000492895 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-211ENST00000492895 G3V3G9 751 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-211ENST00000492895 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ANKRD28-211ENST00000492895 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.21□□□□□ -1.1
ANKRD28-211ENST00000492895 MICALL2Q8IY33 904 aa8.2□□□□□ -1.1
ANKRD28-211ENST00000492895 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP1R37O75864 691 aa8.19□□□□□ -1.1
ANKRD28-211ENST00000492895 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.19□□□□□ -1.1
ANKRD28-211ENST00000492895 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
ANKRD28-211ENST00000492895 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
ANKRD28-211ENST00000492895 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.11□□□□□ -1.11
ANKRD28-211ENST00000492895 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD28-211ENST00000492895 SNPHO15079 494 aa8.06□□□□□ -1.12
ANKRD28-211ENST00000492895 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
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