RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 FAM212AQ96EL1 285 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRC-212ENST00000491302 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRC-212ENST00000491302 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
PTPRC-212ENST00000491302 HS6ST3Q8IZP7 471 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRC-212ENST00000491302 PITPNM1O00562 1244 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRC-212ENST00000491302 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
PTPRC-212ENST00000491302 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
PTPRC-212ENST00000491302 BCANQ96GW7 911 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRC-212ENST00000491302 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRC-212ENST00000491302 RASEFQ8IZ41 740 aa17.63■□□□□ 0.41
PTPRC-212ENST00000491302 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.6■□□□□ 0.41
PTPRC-212ENST00000491302 VGFO15240 615 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
PTPRC-212ENST00000491302 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRC-212ENST00000491302 SGIP1Q9BQI5 828 aa17.51■□□□□ 0.39
PTPRC-212ENST00000491302 STK25O00506 426 aa17.5■□□□□ 0.39
PTPRC-212ENST00000491302 PYGBP11216 843 aa17.46■□□□□ 0.39
PTPRC-212ENST00000491302 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.43■□□□□ 0.38
PTPRC-212ENST00000491302 CHADLQ6NUI6 762 aa17.42■□□□□ 0.38
PTPRC-212ENST00000491302 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
PTPRC-212ENST00000491302 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
PTPRC-212ENST00000491302 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
PTPRC-212ENST00000491302 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
PTPRC-212ENST00000491302 STK24Q9Y6E0 443 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRC-212ENST00000491302 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
PTPRC-212ENST00000491302 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRC-212ENST00000491302 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
PTPRC-212ENST00000491302 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
PTPRC-212ENST00000491302 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRC-212ENST00000491302 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRC-212ENST00000491302 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC61Q9Y6R9 512 aa17.19■□□□□ 0.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
PTPRC-212ENST00000491302 NBR1Q14596 966 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHB8Q9UN66 801 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa17.12■□□□□ 0.33
PTPRC-212ENST00000491302 PSEN1P49768 467 aa17.08■□□□□ 0.32
PTPRC-212ENST00000491302 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
PTPRC-212ENST00000491302 TPRNQ4KMQ1 711 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRC-212ENST00000491302 IFNL1Q8IU54 200 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRC-212ENST00000491302 KIF12Q96FN5 646 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K13O43283 966 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRC-212ENST00000491302 P3H3Q8IVL6 736 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRC-212ENST00000491302 MFRPQ9BY79 579 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRC-212ENST00000491302 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRC-212ENST00000491302 WDR70Q9NW82 654 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRC-212ENST00000491302 SOX12O15370 315 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRC-212ENST00000491302 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP6P59044 892 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRC-212ENST00000491302 CABP2Q9NPB3 220 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRC-212ENST00000491302 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRC-212ENST00000491302 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.79■□□□□ 0.28
PTPRC-212ENST00000491302 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.78■□□□□ 0.28
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.77■□□□□ 0.28
PTPRC-212ENST00000491302 POTEHQ6S545 545 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRC-212ENST00000491302 PHF12Q96QT6 1004 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRC-212ENST00000491302 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRC-212ENST00000491302 EVX2Q03828 476 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R37O75864 691 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA2Q08379 1002 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRC-212ENST00000491302 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRC-212ENST00000491302 HAX1O00165 279 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRC-212ENST00000491302 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRC-212ENST00000491302 E2F4Q16254 413 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-212ENST00000491302 PDE4AP27815 886 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-212ENST00000491302 TIE1P35590 1138 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-212ENST00000491302 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRC-212ENST00000491302 TRPC6Q9Y210 931 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRC-212ENST00000491302 CLCN6P51797 869 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRC-212ENST00000491302 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRC-212ENST00000491302 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRC-212ENST00000491302 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRC-212ENST00000491302 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
PTPRC-212ENST00000491302 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.44■□□□□ 0.22
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD10Q14728 455 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRC-212ENST00000491302 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.43■□□□□ 0.22
PTPRC-212ENST00000491302 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
PTPRC-212ENST00000491302 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
PTPRC-212ENST00000491302 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PTPRC-212ENST00000491302 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PTPRC-212ENST00000491302 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRC-212ENST00000491302 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRC-212ENST00000491302 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
PTPRC-212ENST00000491302 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA3EO15041 775 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRC-212ENST00000491302 CAMK2BQ13554 666 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRC-212ENST00000491302 GABBR2O75899 941 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRC-212ENST00000491302 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRC-212ENST00000491302 IER5LQ5T953 404 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRC-212ENST00000491302 MICALL2Q8IY33 904 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRC-212ENST00000491302 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
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