RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.27
NISCH-213ENST00000489895 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 54.5
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NISCH-213ENST00000489895 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.89■■□□□ 1.25
NISCH-213ENST00000489895 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.86■■□□□ 1.25
NISCH-213ENST00000489895 MRS2Q9HD23 443 aa22.86■■□□□ 1.25
NISCH-213ENST00000489895 FKBP8Q14318 412 aa22.86■■□□□ 1.25
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
NISCH-213ENST00000489895 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.83■■□□□ 1.24
NISCH-213ENST00000489895 SMARCA2P51531 1590 aa22.82■■□□□ 1.24
NISCH-213ENST00000489895 CDCA8Q53HL2 280 aa22.8■■□□□ 1.24
NISCH-213ENST00000489895 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
NISCH-213ENST00000489895 CUX2O14529 1486 aa22.79■■□□□ 1.24
NISCH-213ENST00000489895 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NISCH-213ENST00000489895 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-213ENST00000489895 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.73■■□□□ 1.23
NISCH-213ENST00000489895 RGL3Q3MIN7 710 aa22.72■■□□□ 1.23
NISCH-213ENST00000489895 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.71■■□□□ 1.23
NISCH-213ENST00000489895 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NISCH-213ENST00000489895 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.7■■□□□ 1.22
NISCH-213ENST00000489895 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
NISCH-213ENST00000489895 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.69■■□□□ 1.22
NISCH-213ENST00000489895 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
NISCH-213ENST00000489895 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NISCH-213ENST00000489895 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NISCH-213ENST00000489895 MIER1Q8N108 512 aa22.64■■□□□ 1.21
NISCH-213ENST00000489895 CFAP53Q96M91 514 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-213ENST00000489895 SOGA1O94964 1423 aa22.63■■□□□ 1.21
NISCH-213ENST00000489895 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NISCH-213ENST00000489895 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.62■■□□□ 1.21
NISCH-213ENST00000489895 C14orf37Q86TY3 774 aa22.61■■□□□ 1.21
NISCH-213ENST00000489895 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-213ENST00000489895 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-213ENST00000489895 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-213ENST00000489895 KANK1Q14678 1352 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-213ENST00000489895 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.53■■□□□ 1.2
NISCH-213ENST00000489895 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
NISCH-213ENST00000489895 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
NISCH-213ENST00000489895 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.51■■□□□ 1.19
NISCH-213ENST00000489895 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NISCH-213ENST00000489895 POGKQ9P215 609 aa22.48■■□□□ 1.19
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.47■■□□□ 1.19
NISCH-213ENST00000489895 FMN1Q68DA7 1419 aa22.46■■□□□ 1.19
NISCH-213ENST00000489895 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.46■■□□□ 1.19
NISCH-213ENST00000489895 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NISCH-213ENST00000489895 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.46■■□□□ 1.19
NISCH-213ENST00000489895 ABCC8Q09428 1581 aa22.44■■□□□ 1.18
NISCH-213ENST00000489895 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-213ENST00000489895 NUDCQ9Y266 331 aa22.43■■□□□ 1.18
NISCH-213ENST00000489895 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
NISCH-213ENST00000489895 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NISCH-213ENST00000489895 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.38■■□□□ 1.17
NISCH-213ENST00000489895 A0A0G2JS52 829 aa22.37■■□□□ 1.17
NISCH-213ENST00000489895 TMF1P82094 1093 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-213ENST00000489895 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.36■■□□□ 1.17
NISCH-213ENST00000489895 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.35■■□□□ 1.17
NISCH-213ENST00000489895 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NISCH-213ENST00000489895 WIZO95785 1651 aa22.34■■□□□ 1.17
NISCH-213ENST00000489895 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.33■■□□□ 1.17
NISCH-213ENST00000489895 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.33■■□□□ 1.17
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHG5O94827 1062 aa22.32■■□□□ 1.16
NISCH-213ENST00000489895 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NISCH-213ENST00000489895 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-213ENST00000489895 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NISCH-213ENST00000489895 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NISCH-213ENST00000489895 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.25■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 PKD2Q13563 968 aa22.24■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 SMARCA4P51532 1647 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.23■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 GGT6Q6P531 493 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.22■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 MLECQ14165 292 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 BECN1Q14457 450 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-213ENST00000489895 MS4A1P11836 297 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-213ENST00000489895 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-213ENST00000489895 NEUROD2Q15784 382 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-213ENST00000489895 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-213ENST00000489895 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NISCH-213ENST00000489895 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-213ENST00000489895 NUP155O75694 1391 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-213ENST00000489895 CASC1Q6TDU7 716 aa22.14■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.14■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 JPH4Q96JJ6 628 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 CCER2I3L3R5 266 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 MORC1Q86VD1 984 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.09■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.08■■□□□ 1.13
NISCH-213ENST00000489895 ARXQ96QS3 562 aa22.08■■□□□ 1.12
NISCH-213ENST00000489895 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms