RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489114.1

PTPRZ1-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRZ1, Length 571 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-209ENST00000489114 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
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PTPRZ1-209ENST00000489114 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
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PTPRZ1-209ENST00000489114 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRZ1-209ENST00000489114 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
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PTPRZ1-209ENST00000489114 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRZ1-209ENST00000489114 RIMBP2O15034 1052 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRZ1-209ENST00000489114 KLHL34Q8N239 644 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRZ1-209ENST00000489114 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRZ1-209ENST00000489114 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRZ1-209ENST00000489114 GPR153Q6NV75 609 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRZ1-209ENST00000489114 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRZ1-209ENST00000489114 MICALL2Q8IY33 904 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRZ1-209ENST00000489114 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRZ1-209ENST00000489114 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRZ1-209ENST00000489114 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
PTPRZ1-209ENST00000489114 ARSIQ5FYB1 569 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRZ1-209ENST00000489114 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
PTPRZ1-209ENST00000489114 SPOCK2Q92563 424 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRZ1-209ENST00000489114 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
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