RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482305.1

RFWD2-208, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, human

TSL 2

Gene RFWD2, Length 450 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFWD2-208	ENST00000482305	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RFWD2-208	ENST00000482305	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RFWD2-208	ENST00000482305	C7	P10643	843 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RFWD2-208	ENST00000482305	SLC39A7	Q92504	469 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RFWD2-208	ENST00000482305	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		5.11	□□□□□ -1.59
RFWD2-208	ENST00000482305	PHF12	Q96QT6	1004 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RFWD2-208	ENST00000482305	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RFWD2-208	ENST00000482305	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RFWD2-208	ENST00000482305	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RFWD2-208	ENST00000482305	CREBZF	Q9NS37	354 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RFWD2-208	ENST00000482305	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
RFWD2-208	ENST00000482305	ST18	O60284	1047 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RFWD2-208	ENST00000482305	PLEKHG5	O94827	1062 aa		5	□□□□□ -1.61
RFWD2-208	ENST00000482305	PROM2	Q8N271	834 aa		5	□□□□□ -1.61
RFWD2-208	ENST00000482305	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		5	□□□□□ -1.61
RFWD2-208	ENST00000482305	POTEF	A5A3E0	1075 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFWD2-208	ENST00000482305	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFWD2-208	ENST00000482305	FKBP8	Q14318	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFWD2-208	ENST00000482305	MIER1	Q8N108	512 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFWD2-208	ENST00000482305	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFWD2-208	ENST00000482305	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RFWD2-208	ENST00000482305	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RFWD2-208	ENST00000482305	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RFWD2-208	ENST00000482305	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RFWD2-208	ENST00000482305	SEC24B	O95487	1268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RFWD2-208	ENST00000482305	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	MARVELD3	Q96A59	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	FBXO3	Q9UK99	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	RASEF	Q8IZ41	740 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	KIF12	Q96FN5	646 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RFWD2-208	ENST00000482305	SNPH	O15079	494 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	FAM212A	Q96EL1	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	MAP3K13	O43283	966 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	TIE1	P35590	1138 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	KLHL34	Q8N239	644 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	NUBP1	P53384	320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	TRPC6	Q9Y210	931 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	EMP3	P54852	163 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	IER5L	Q5T953	404 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RFWD2-208	ENST00000482305	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	POTEB3	A0JP26	581 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	FAM205C	A6NFA0	338 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	PYGB	P11216	843 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	POTEB	Q6S5H4	581 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	GSE1	Q14687	1217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	IFNL1	Q8IU54	200 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	PLCG2	P16885	1265 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RFWD2-208	ENST00000482305	SPOCK2	Q92563	424 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	GOLGA2	Q08379	1002 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RFWD2-208	ENST00000482305	OCEL1	Q9H607	264 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	PSEN1	P49768	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	TRIM41	Q8WV44	630 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	CABP2	Q9NPB3	220 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RFWD2-208	ENST00000482305	ERBB3	P21860	1342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFWD2-208	ENST00000482305		G3V3G9	751 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFWD2-208	ENST00000482305	PTGER2	P43116	358 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RFWD2-208	ENST00000482305	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RFWD2-208	ENST00000482305	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RFWD2-208	ENST00000482305	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RFWD2-208	ENST00000482305	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RFWD2-208	ENST00000482305	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RFWD2-208	ENST00000482305	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RFWD2-208	ENST00000482305	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	SOX12	O15370	315 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RFWD2-208	ENST00000482305	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69

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