RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGGTB-205ENST00000462042 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGGTB-205ENST00000462042 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
RABGGTB-205ENST00000462042 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGGTB-205ENST00000462042 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGGTB-205ENST00000462042 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-205ENST00000462042 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PYGBP11216 843 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-205ENST00000462042 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RABGGTB-205ENST00000462042 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.59□□□□□ -0.23
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.59□□□□□ -0.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RABGGTB-205ENST00000462042 CFAP44Q96MT7 982 aa13.54□□□□□ -0.24
RABGGTB-205ENST00000462042 STK25O00506 426 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.52□□□□□ -0.25
RABGGTB-205ENST00000462042 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGGTB-205ENST00000462042 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGGTB-205ENST00000462042 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RABGGTB-205ENST00000462042 STK24Q9Y6E0 443 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGGTB-205ENST00000462042 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGGTB-205ENST00000462042 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
RABGGTB-205ENST00000462042 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa13.38□□□□□ -0.27
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.37□□□□□ -0.27
RABGGTB-205ENST00000462042 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF12Q96FN5 646 aa13.36□□□□□ -0.27
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP3K13O43283 966 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PSEN1P49768 467 aa13.33□□□□□ -0.28
RABGGTB-205ENST00000462042 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
RABGGTB-205ENST00000462042 IFNL1Q8IU54 200 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGGTB-205ENST00000462042 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.3□□□□□ -0.28
RABGGTB-205ENST00000462042 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.29□□□□□ -0.28
RABGGTB-205ENST00000462042 PHF12Q96QT6 1004 aa13.24□□□□□ -0.29
RABGGTB-205ENST00000462042 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.23□□□□□ -0.29
RABGGTB-205ENST00000462042 CLCN6P51797 869 aa13.17□□□□□ -0.3
RABGGTB-205ENST00000462042 SOX12O15370 315 aa13.16□□□□□ -0.3
RABGGTB-205ENST00000462042 BCANQ96GW7 911 aa13.16□□□□□ -0.3
RABGGTB-205ENST00000462042 CABP2Q9NPB3 220 aa13.14□□□□□ -0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 HAX1O00165 279 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 NLRP6P59044 892 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.12□□□□□ -0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 MFRPQ9BY79 579 aa13.11□□□□□ -0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA2Q08379 1002 aa13.1□□□□□ -0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.09□□□□□ -0.31
RABGGTB-205ENST00000462042 TIE1P35590 1138 aa13.08□□□□□ -0.32
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.03□□□□□ -0.32
RABGGTB-205ENST00000462042 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
RABGGTB-205ENST00000462042 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.01□□□□□ -0.33
RABGGTB-205ENST00000462042 TRPC6Q9Y210 931 aa12.99□□□□□ -0.33
RABGGTB-205ENST00000462042 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.97□□□□□ -0.33
RABGGTB-205ENST00000462042 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RABGGTB-205ENST00000462042 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR70Q9NW82 654 aa12.94□□□□□ -0.34
RABGGTB-205ENST00000462042 EVX2Q03828 476 aa12.93□□□□□ -0.34
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R37O75864 691 aa12.92□□□□□ -0.34
RABGGTB-205ENST00000462042 NBR1Q14596 966 aa12.91□□□□□ -0.34
RABGGTB-205ENST00000462042 P3H3Q8IVL6 736 aa12.9□□□□□ -0.34
RABGGTB-205ENST00000462042 MS4A4AQ96JQ5 239 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.89□□□□□ -0.35
RABGGTB-205ENST00000462042 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.88□□□□□ -0.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
RABGGTB-205ENST00000462042 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
RABGGTB-205ENST00000462042 POTEHQ6S545 545 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGGTB-205ENST00000462042 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGGTB-205ENST00000462042 IER5LQ5T953 404 aa12.82□□□□□ -0.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE4AP27815 886 aa12.8□□□□□ -0.36
RABGGTB-205ENST00000462042 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
RABGGTB-205ENST00000462042 GABBR2O75899 941 aa12.79□□□□□ -0.36
RABGGTB-205ENST00000462042 OCEL1Q9H607 264 aa12.75□□□□□ -0.37
RABGGTB-205ENST00000462042 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGGTB-205ENST00000462042 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGGTB-205ENST00000462042 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGGTB-205ENST00000462042 E2F4Q16254 413 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGGTB-205ENST00000462042 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGGTB-205ENST00000462042 MFSD10Q14728 455 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNV2Q8TDN2 545 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGGTB-205ENST00000462042 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
RABGGTB-205ENST00000462042 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 G3V3G9 751 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 PLCG2P16885 1265 aa12.69□□□□□ -0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 DPY19L2Q6NUT2 758 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 MICALL2Q8IY33 904 aa12.66□□□□□ -0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC39A7Q92504 469 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
RABGGTB-205ENST00000462042 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
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