RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 TSPY4P0CV99 314 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRU-204ENST00000428026 TSPY10P0CW01 314 aa19.46■□□□□ 0.71
PTPRU-204ENST00000428026 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
PTPRU-204ENST00000428026 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRU-204ENST00000428026 KIF27Q86VH2 1401 aa19.44■□□□□ 0.7
PTPRU-204ENST00000428026 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.43■□□□□ 0.7
PTPRU-204ENST00000428026 CLIP1P30622 1438 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRU-204ENST00000428026 TMC1Q8TDI8 760 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRU-204ENST00000428026 MRS2Q9HD23 443 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRU-204ENST00000428026 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.4■□□□□ 0.7
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
PTPRU-204ENST00000428026 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
PTPRU-204ENST00000428026 SMARCA2P51531 1590 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 EEA1Q15075 1411 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.3■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA3Q08378 1498 aa19.29■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 CUX2O14529 1486 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRU-204ENST00000428026 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.26■□□□□ 0.67
PTPRU-204ENST00000428026 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
PTPRU-204ENST00000428026 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
PTPRU-204ENST00000428026 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
PTPRU-204ENST00000428026 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.21■□□□□ 0.67
PTPRU-204ENST00000428026 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.2■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 CEP162Q5TB80 1403 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 SOGA1O94964 1423 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRU-204ENST00000428026 BECN1Q14457 450 aa19.14■□□□□ 0.65
PTPRU-204ENST00000428026 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.11■□□□□ 0.65
PTPRU-204ENST00000428026 WIZO95785 1651 aa19.1■□□□□ 0.65
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
PTPRU-204ENST00000428026 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
PTPRU-204ENST00000428026 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
PTPRU-204ENST00000428026 ABCC8Q09428 1581 aa19.08■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.07■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.07■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.04■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 TPRNQ4KMQ1 711 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 RGL3Q3MIN7 710 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.03■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 PLEKHG5O94827 1062 aa19.02■□□□□ 0.64
PTPRU-204ENST00000428026 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 PTMAP06454 111 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 C14orf37Q86TY3 774 aa19■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 MLECQ14165 292 aa18.99■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.97■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 SMARCA4P51532 1647 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRU-204ENST00000428026 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRU-204ENST00000428026 RGS3P49796 1198 aa18.95■□□□□ 0.62
PTPRU-204ENST00000428026 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRU-204ENST00000428026 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTPRU-204ENST00000428026 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRU-204ENST00000428026 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRU-204ENST00000428026 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PTPRU-204ENST00000428026 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRU-204ENST00000428026 PLCB2Q00722 1185 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-204ENST00000428026 JPH4Q96JJ6 628 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRU-204ENST00000428026 NEUROD2Q15784 382 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRU-204ENST00000428026 A0A0G2JS52 829 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRU-204ENST00000428026 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRU-204ENST00000428026 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRU-204ENST00000428026 GGT6Q6P531 493 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRU-204ENST00000428026 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
PTPRU-204ENST00000428026 OSCARQ8IYS5 282 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRU-204ENST00000428026 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-204ENST00000428026 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRU-204ENST00000428026 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 CASC1Q6TDU7 716 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRU-204ENST00000428026 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRU-204ENST00000428026 POGKQ9P215 609 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRU-204ENST00000428026 KANK1Q14678 1352 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRU-204ENST00000428026 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRU-204ENST00000428026 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRU-204ENST00000428026 NCAPD3P42695 1498 aa18.68■□□□□ 0.58
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