RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411333.1

RNU6-592P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 592, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-592P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-592P-201ENST00000411333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-592P-201ENST00000411333 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-592P-201ENST00000411333 SEC24BO95487 1268 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-592P-201ENST00000411333 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-592P-201ENST00000411333 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-592P-201ENST00000411333 SNPHO15079 494 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-592P-201ENST00000411333 POTEFA5A3E0 1075 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-592P-201ENST00000411333 MARVELD3Q96A59 401 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-592P-201ENST00000411333 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-592P-201ENST00000411333 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-592P-201ENST00000411333 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-592P-201ENST00000411333 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-592P-201ENST00000411333 CREBZFQ9NS37 354 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-592P-201ENST00000411333 EMP3P54852 163 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-592P-201ENST00000411333 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-592P-201ENST00000411333 KCNA4P22459 653 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-592P-201ENST00000411333 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-592P-201ENST00000411333 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-592P-201ENST00000411333 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-592P-201ENST00000411333 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-592P-201ENST00000411333 FAM205CA6NFA0 338 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-592P-201ENST00000411333 TIE1P35590 1138 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-592P-201ENST00000411333 IER5LQ5T953 404 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-592P-201ENST00000411333 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-592P-201ENST00000411333 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-592P-201ENST00000411333 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-592P-201ENST00000411333 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-592P-201ENST00000411333 POTEB3A0JP26 581 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 PLCG2P16885 1265 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 POTEBQ6S5H4 581 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 PTGER2P43116 358 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 KIF12Q96FN5 646 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 TRPC6Q9Y210 931 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-592P-201ENST00000411333 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-592P-201ENST00000411333 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-592P-201ENST00000411333 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-592P-201ENST00000411333 MAP3K13O43283 966 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-592P-201ENST00000411333 ERBB3P21860 1342 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-592P-201ENST00000411333 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-592P-201ENST00000411333 OCEL1Q9H607 264 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-592P-201ENST00000411333 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-592P-201ENST00000411333 RGS20O76081 388 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-592P-201ENST00000411333 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-592P-201ENST00000411333 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-592P-201ENST00000411333 HCSTQ9UBK5 93 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-592P-201ENST00000411333 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-592P-201ENST00000411333 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-592P-201ENST00000411333 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-592P-201ENST00000411333 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-592P-201ENST00000411333 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-592P-201ENST00000411333 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-592P-201ENST00000411333 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-592P-201ENST00000411333 Q6ZNB5 142 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-592P-201ENST00000411333 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-592P-201ENST00000411333 RIMBP2O15034 1052 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-592P-201ENST00000411333 DOK7Q18PE1 504 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-592P-201ENST00000411333 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-592P-201ENST00000411333 IFNL1Q8IU54 200 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-592P-201ENST00000411333 PLEKHG5O94827 1062 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-592P-201ENST00000411333 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-592P-201ENST00000411333 RASEFQ8IZ41 740 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-592P-201ENST00000411333 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-592P-201ENST00000411333 G3V3G9 751 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-592P-201ENST00000411333 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-592P-201ENST00000411333 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-592P-201ENST00000411333 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-592P-201ENST00000411333 ZBTB22O15209 634 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-592P-201ENST00000411333 GOLGA2Q08379 1002 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-592P-201ENST00000411333 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-592P-201ENST00000411333 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-592P-201ENST00000411333 LAPTM4AQ15012 233 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-592P-201ENST00000411333 IFFO2Q5TF58 517 aa5.99□□□□□ -1.45
RNU6-592P-201ENST00000411333 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-592P-201ENST00000411333 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-592P-201ENST00000411333 A0A0G2JS52 829 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-592P-201ENST00000411333 PBX2P40425 430 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-592P-201ENST00000411333 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-592P-201ENST00000411333 ZNF787Q6DD87 383 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-592P-201ENST00000411333 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-592P-201ENST00000411333 GPR153Q6NV75 609 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-592P-201ENST00000411333 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-592P-201ENST00000411333 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-592P-201ENST00000411333 MIER1Q8N108 512 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-592P-201ENST00000411333 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RNU6-592P-201ENST00000411333 FAM212AQ96EL1 285 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-592P-201ENST00000411333 STAC3Q96MF2 364 aa5.87□□□□□ -1.47
RNU6-592P-201ENST00000411333 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.85□□□□□ -1.47
RNU6-592P-201ENST00000411333 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RNU6-592P-201ENST00000411333 LCE2BO14633 110 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-592P-201ENST00000411333 GFRA3O60609 400 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-592P-201ENST00000411333 PTPN5P54829 565 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-592P-201ENST00000411333 ARSIQ5FYB1 569 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-592P-201ENST00000411333 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-592P-201ENST00000411333 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-592P-201ENST00000411333 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-592P-201ENST00000411333 TK2O00142 265 aa5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms