RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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RABGGTB-202ENST00000370826 PHF12Q96QT6 1004 aa10.58□□□□□ -0.72
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RABGGTB-202ENST00000370826 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.56□□□□□ -0.72
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RABGGTB-202ENST00000370826 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-202ENST00000370826 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
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RABGGTB-202ENST00000370826 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.32□□□□□ -0.76
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RABGGTB-202ENST00000370826 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
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RABGGTB-202ENST00000370826 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF12Q96FN5 646 aa10.25□□□□□ -0.77
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RABGGTB-202ENST00000370826 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-202ENST00000370826 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
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RABGGTB-202ENST00000370826 PSEN1P49768 467 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-202ENST00000370826 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-202ENST00000370826 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-202ENST00000370826 STK24Q9Y6E0 443 aa10.06□□□□□ -0.8
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-202ENST00000370826 PLCB2Q00722 1185 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGGTB-202ENST00000370826 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RABGGTB-202ENST00000370826 IER5LQ5T953 404 aa10□□□□□ -0.81
RABGGTB-202ENST00000370826 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.99□□□□□ -0.81
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RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP44Q96MT7 982 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-202ENST00000370826 CABP2Q9NPB3 220 aa9.94□□□□□ -0.82
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RABGGTB-202ENST00000370826 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 MFRPQ9BY79 579 aa9.87□□□□□ -0.83
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RABGGTB-202ENST00000370826 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGGTB-202ENST00000370826 ST18O60284 1047 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-202ENST00000370826 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-202ENST00000370826 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-202ENST00000370826 OCEL1Q9H607 264 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRP6P59044 892 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-202ENST00000370826 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-202ENST00000370826 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.78□□□□□ -0.84
RABGGTB-202ENST00000370826 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
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