RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.8□□□□□ -0.04
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUBP1P53384 320 aa14.79□□□□□ -0.04
RNU1-38P-201ENST00000362817 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RNU1-38P-201ENST00000362817 EVX2Q03828 476 aa14.78□□□□□ -0.04
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPOCK2Q92563 424 aa14.78□□□□□ -0.04
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLCN6P51797 869 aa14.77□□□□□ -0.05
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM212AQ96EL1 285 aa14.77□□□□□ -0.05
RNU1-38P-201ENST00000362817 RASEFQ8IZ41 740 aa14.75□□□□□ -0.05
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RNU1-38P-201ENST00000362817 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.73□□□□□ -0.05
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCRIBQ14160 1630 aa14.7□□□□□ -0.06
RNU1-38P-201ENST00000362817 GSE1Q14687 1217 aa14.67□□□□□ -0.06
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.65□□□□□ -0.06
RNU1-38P-201ENST00000362817 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.64□□□□□ -0.07
RNU1-38P-201ENST00000362817 GABBR2O75899 941 aa14.58□□□□□ -0.08
RNU1-38P-201ENST00000362817 PHF12Q96QT6 1004 aa14.58□□□□□ -0.08
RNU1-38P-201ENST00000362817 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RNU1-38P-201ENST00000362817 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.53□□□□□ -0.08
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIF12Q96FN5 646 aa14.53□□□□□ -0.08
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM41Q8WV44 630 aa14.52□□□□□ -0.09
RNU1-38P-201ENST00000362817 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.51□□□□□ -0.09
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAP3K13O43283 966 aa14.45□□□□□ -0.1
RNU1-38P-201ENST00000362817 PYGBP11216 843 aa14.45□□□□□ -0.1
RNU1-38P-201ENST00000362817 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.43□□□□□ -0.1
RNU1-38P-201ENST00000362817 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.42□□□□□ -0.1
RNU1-38P-201ENST00000362817 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.39□□□□□ -0.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFNL1Q8IU54 200 aa14.33□□□□□ -0.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TIE1P35590 1138 aa14.29□□□□□ -0.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.26□□□□□ -0.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 PKD2Q13563 968 aa14.26□□□□□ -0.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.25□□□□□ -0.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.22□□□□□ -0.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 POTEIP0CG38 1075 aa14.21□□□□□ -0.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRPC6Q9Y210 931 aa14.2□□□□□ -0.14
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.18□□□□□ -0.14
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.18□□□□□ -0.14
RNU1-38P-201ENST00000362817 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.15□□□□□ -0.14
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSEN1P49768 467 aa14.15□□□□□ -0.14
RNU1-38P-201ENST00000362817 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
RNU1-38P-201ENST00000362817 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC39A7Q92504 469 aa14.11□□□□□ -0.15
RNU1-38P-201ENST00000362817 C7P10643 843 aa14.09□□□□□ -0.15
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.09□□□□□ -0.15
RNU1-38P-201ENST00000362817 IER5LQ5T953 404 aa14.07□□□□□ -0.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMARCA4P51532 1647 aa14.06□□□□□ -0.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 RGL2O15211 777 aa14.06□□□□□ -0.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOLGA2Q08379 1002 aa14.06□□□□□ -0.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 METRNQ9UJH8 293 aa14.03□□□□□ -0.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.98□□□□□ -0.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.97□□□□□ -0.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 NCAPD3P42695 1498 aa13.97□□□□□ -0.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 SEC24BO95487 1268 aa13.96□□□□□ -0.17
RNU1-38P-201ENST00000362817 CABP2Q9NPB3 220 aa13.95□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMARCA2P51531 1590 aa13.95□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.93□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 STK25O00506 426 aa13.93□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 HMGXB3Q12766 1538 aa13.9□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLCG2P16885 1265 aa13.9□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 OCEL1Q9H607 264 aa13.9□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 STK24Q9Y6E0 443 aa13.9□□□□□ -0.18
RNU1-38P-201ENST00000362817 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
RNU1-38P-201ENST00000362817 LHX8Q68G74 356 aa13.87□□□□□ -0.19
RNU1-38P-201ENST00000362817 SOX12O15370 315 aa13.85□□□□□ -0.19
RNU1-38P-201ENST00000362817 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.85□□□□□ -0.19
RNU1-38P-201ENST00000362817 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP13.85□□□□□ -0.19
RNU1-38P-201ENST00000362817 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RNU1-38P-201ENST00000362817 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.84□□□□□ -0.19
RNU1-38P-201ENST00000362817 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
RNU1-38P-201ENST00000362817 WIZO95785 1651 aa13.83□□□□□ -0.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 POTEFA5A3E0 1075 aa13.81□□□□□ -0.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.79□□□□□ -0.2
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 NLRP6P59044 892 aa13.75□□□□□ -0.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.75□□□□□ -0.21
RNU1-38P-201ENST00000362817 POTEB2H3BUK9 544 aa13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms