RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282096.8

PDE3B-201, Transcript of phosphodiesterase 3B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE3B, Length 6,076 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3B-201ENST00000282096 MRS2Q9HD23 443 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE3B-201ENST00000282096 BECN1Q14457 450 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE3B-201ENST00000282096 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PDE3B-201ENST00000282096 KCNH8Q96L42 1107 aa23.39■■□□□ 1.34
PDE3B-201ENST00000282096 TSPY4P0CV99 314 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 TSPY10P0CW01 314 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.32■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.31■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.29■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.28■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.24■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.24■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 C14orf37Q86TY3 774 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.22■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.21■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PDE3B-201ENST00000282096 A0A0G2JS52 829 aa23.15■■□□□ 1.3
PDE3B-201ENST00000282096 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.15■■□□□ 1.3
PDE3B-201ENST00000282096 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PDE3B-201ENST00000282096 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.12■■□□□ 1.29
PDE3B-201ENST00000282096 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PDE3B-201ENST00000282096 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PDE3B-201ENST00000282096 PLCB2Q00722 1185 aa23.08■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 CLIP1P30622 1438 aa23.05■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.04■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 PLEKHG5O94827 1062 aa23.03■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA3Q08378 1498 aa22.99■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 EEA1Q15075 1411 aa22.99■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 CEP162Q5TB80 1403 aa22.96■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 CASC1Q6TDU7 716 aa22.96■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 RGS3P49796 1198 aa22.94■■□□□ 1.26
PDE3B-201ENST00000282096 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PDE3B-201ENST00000282096 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.93■■□□□ 1.26
PDE3B-201ENST00000282096 KIF27Q86VH2 1401 aa22.91■■□□□ 1.26
PDE3B-201ENST00000282096 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.86■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.86■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.84■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.83■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 ARID3AQ99856 593 aa22.81■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.78■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.78■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.77■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 MLECQ14165 292 aa22.76■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 NEUROD2Q15784 382 aa22.74■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 NRDCO43847 1150 aa22.72■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.71■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 RGL3Q3MIN7 710 aa22.7■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 HSCBQ8IWL3 235 aa22.7■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 DRC7Q8IY82 874 aa22.7■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.69■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 CFAP53Q96M91 514 aa22.68■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.64■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 FGD1P98174 961 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 POGKQ9P215 609 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 CCER2I3L3R5 266 aa22.59■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 CUX2O14529 1486 aa22.59■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 KANK1Q14678 1352 aa22.58■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.58■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 KCNJ4P48050 445 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 SMARCA2P51531 1590 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 CDCA8Q53HL2 280 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.55■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms