RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 MLECQ14165 292 aa18.02■□□□□ 0.48
TMX4-201ENST00000246024 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
TMX4-201ENST00000246024 FKBP8Q14318 412 aa18.01■□□□□ 0.47
TMX4-201ENST00000246024 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
TMX4-201ENST00000246024 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18■□□□□ 0.47
TMX4-201ENST00000246024 TMC1Q8TDI8 760 aa17.98■□□□□ 0.47
TMX4-201ENST00000246024 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
TMX4-201ENST00000246024 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.96■□□□□ 0.46
TMX4-201ENST00000246024 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
TMX4-201ENST00000246024 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.93■□□□□ 0.46
TMX4-201ENST00000246024 NBR1Q14596 966 aa17.92■□□□□ 0.46
TMX4-201ENST00000246024 CCDC136Q96JN2 1154 aa17.9■□□□□ 0.46
TMX4-201ENST00000246024 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TMX4-201ENST00000246024 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa17.89■□□□□ 0.45
TMX4-201ENST00000246024 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.87■□□□□ 0.45
TMX4-201ENST00000246024 TPRNQ4KMQ1 711 aa17.84■□□□□ 0.45
TMX4-201ENST00000246024 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
TMX4-201ENST00000246024 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
TMX4-201ENST00000246024 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.83■□□□□ 0.44
TMX4-201ENST00000246024 NPHP1O15259 732 aa17.83■□□□□ 0.44
TMX4-201ENST00000246024 NCLP19338 710 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TMX4-201ENST00000246024 SOX12O15370 315 aa17.81■□□□□ 0.44
TMX4-201ENST00000246024 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TMX4-201ENST00000246024 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TMX4-201ENST00000246024 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TMX4-201ENST00000246024 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TMX4-201ENST00000246024 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TMX4-201ENST00000246024 CLIP1P30622 1438 aa17.76■□□□□ 0.43
TMX4-201ENST00000246024 MRS2Q9HD23 443 aa17.76■□□□□ 0.43
TMX4-201ENST00000246024 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
TMX4-201ENST00000246024 NEUROD2Q15784 382 aa17.72■□□□□ 0.43
TMX4-201ENST00000246024 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
TMX4-201ENST00000246024 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
TMX4-201ENST00000246024 POGKQ9P215 609 aa17.68■□□□□ 0.42
TMX4-201ENST00000246024 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
TMX4-201ENST00000246024 PTMAP06454 111 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
TMX4-201ENST00000246024 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.64■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 GGT6Q6P531 493 aa17.63■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 CLSTN1O94985 981 aa17.62■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 BECN1Q14457 450 aa17.61■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.59■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 STK26Q9P289 416 aa17.58■□□□□ 0.41
TMX4-201ENST00000246024 CASC1Q6TDU7 716 aa17.58■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.57■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.57■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 GOLGA2Q08379 1002 aa17.56■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 PLCB2Q00722 1185 aa17.56■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 CFAP53Q96M91 514 aa17.55■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.55■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 FGD1P98174 961 aa17.54■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 KIF27Q86VH2 1401 aa17.52■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 CEP162Q5TB80 1403 aa17.52■□□□□ 0.4
TMX4-201ENST00000246024 MIER1Q8N108 512 aa17.51■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.51■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 FOXD1Q16676 465 aa17.49■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.49■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.49■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 GOLGA3Q08378 1498 aa17.48■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 KCNJ4P48050 445 aa17.46■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.46■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.46■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
TMX4-201ENST00000246024 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.45■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 CUX2O14529 1486 aa17.45■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 ANP32EQ9BTT0 268 aa17.45■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.44■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 NACADO15069 1562 aa17.43■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 NUTM2FA1L443 756 aa17.41■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
TMX4-201ENST00000246024 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa17.39■□□□□ 0.37
TMX4-201ENST00000246024 NUDCQ9Y266 331 aa17.37■□□□□ 0.37
TMX4-201ENST00000246024 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.37■□□□□ 0.37
TMX4-201ENST00000246024 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.36■□□□□ 0.37
TMX4-201ENST00000246024 PRM3Q9NNZ6 103 aa17.36■□□□□ 0.37
TMX4-201ENST00000246024 RGS3P49796 1198 aa17.35■□□□□ 0.37
TMX4-201ENST00000246024 CDCA8Q53HL2 280 aa17.35■□□□□ 0.37
TMX4-201ENST00000246024 SOGA1O94964 1423 aa17.34■□□□□ 0.37
TMX4-201ENST00000246024 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17.33■□□□□ 0.36
TMX4-201ENST00000246024 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa17.33■□□□□ 0.36
TMX4-201ENST00000246024 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
TMX4-201ENST00000246024 NRDCO43847 1150 aa17.32■□□□□ 0.36
TMX4-201ENST00000246024 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
TMX4-201ENST00000246024 KANK1Q14678 1352 aa17.3■□□□□ 0.36
TMX4-201ENST00000246024 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
TMX4-201ENST00000246024 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms