RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030622.2

Syf2-201, Transcript of Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syf2, Length 1,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2-201ENSMUST00000030622 Zeb1Q64318 1117 aa24.49■■□□□ 1.51
Syf2-201ENSMUST00000030622 Map3k1P53349 1493 aa24.49■■□□□ 1.51
Syf2-201ENSMUST00000030622 SynmQ70IV5 1561 aa24.46■■□□□ 1.51
Syf2-201ENSMUST00000030622 Fgd6Q69ZL1 1399 aa24.46■■□□□ 1.51
Syf2-201ENSMUST00000030622 Arhgap35Q91YM2 1499 aa24.46■■□□□ 1.51
Syf2-201ENSMUST00000030622 Npm2Q80W85 207 aa24.42■■□□□ 1.5
Syf2-201ENSMUST00000030622 Pla2r1Q62028 1487 aa24.41■■□□□ 1.5
Syf2-201ENSMUST00000030622 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
Syf2-201ENSMUST00000030622 Gpatch8A2A6A1 1505 aa24.39■■□□□ 1.49
Syf2-201ENSMUST00000030622 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.31■■□□□ 1.48
Syf2-201ENSMUST00000030622 AknaQ80VW7 1404 aa24.26■■□□□ 1.47
Syf2-201ENSMUST00000030622 CadpsQ80TJ1 1355 aa24.23■■□□□ 1.47
Syf2-201ENSMUST00000030622 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa24.2■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 Myt1lP97500 1187 aa24.18■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 Clip1Q922J3 1391 aa24.18■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 Abcc1O35379 1528 aa24.17■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa24.16■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 Carmil1Q6EDY6 1374 aa24.16■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 Adgrl3Q80TS3 1537 aa24.16■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 Arhgap27A2AB59 869 aa24.16■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 Cep170Q6A065 1588 aa24.14■■□□□ 1.46
Syf2-201ENSMUST00000030622 Eea1Q8BL66 1411 aa24.13■■□□□ 1.45
Syf2-201ENSMUST00000030622 Adamts12Q811B3 1600 aa24.12■■□□□ 1.45
Syf2-201ENSMUST00000030622 Gm156Q58A37 223 aa24.11■■□□□ 1.45
Syf2-201ENSMUST00000030622 Erich3F6QRE9 1637 aa24.1■■□□□ 1.45
Syf2-201ENSMUST00000030622 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Syf2-201ENSMUST00000030622 Soga1E1U8D0 1418 aa24.09■■□□□ 1.45
Syf2-201ENSMUST00000030622 WizO88286 1684 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Syf2-201ENSMUST00000030622 PxdnQ3UQ28 1475 aa24.08■■□□□ 1.45
Syf2-201ENSMUST00000030622 Abca16E9PWJ7 1678 aa24.08■■□□□ 1.44
Syf2-201ENSMUST00000030622 Abcc2Q8VI47 1543 aa24.06■■□□□ 1.44
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Syf2-201ENSMUST00000030622 Map3k4O08648 1597 aa24.06■■□□□ 1.44
Syf2-201ENSMUST00000030622 Neo1P97798 1493 aa24.05■■□□□ 1.44
Syf2-201ENSMUST00000030622 Gm14025A2AP89 1413 aa24.03■■□□□ 1.44
Syf2-201ENSMUST00000030622 Arap1Q4LDD4 1452 aa24.01■■□□□ 1.43
Syf2-201ENSMUST00000030622 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa24.01■■□□□ 1.43
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ankrd26Q811D2 1581 aa24.01■■□□□ 1.43
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa24■■□□□ 1.43
Syf2-201ENSMUST00000030622 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
Syf2-201ENSMUST00000030622 Rpap1Q80TE0 1409 aa23.99■■□□□ 1.43
Syf2-201ENSMUST00000030622 Chd1P40201 1711 aa23.97■■□□□ 1.43
Syf2-201ENSMUST00000030622 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa23.97■■□□□ 1.43
Syf2-201ENSMUST00000030622 Setd5Q5XJV7 1441 aa23.96■■□□□ 1.43
Syf2-201ENSMUST00000030622 BC005561E9Q5E2 1589 aa23.95■■□□□ 1.42
Syf2-201ENSMUST00000030622 PtprtQ99M80 1454 aa23.94■■□□□ 1.42
Syf2-201ENSMUST00000030622 Slx4Q6P1D7 1565 aa23.92■■□□□ 1.42
Syf2-201ENSMUST00000030622 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
Syf2-201ENSMUST00000030622 Jph4Q80WT0 628 aa23.89■■□□□ 1.41
Syf2-201ENSMUST00000030622 Tiam1Q60610 1591 aa23.88■■□□□ 1.41
Syf2-201ENSMUST00000030622 Mier1Q5UAK0 511 aa23.86■■□□□ 1.41
Syf2-201ENSMUST00000030622 Cux1P53564 1515 aa23.85■■□□□ 1.41
Syf2-201ENSMUST00000030622 Fyco1Q8VDC1 1437 aa23.83■■□□□ 1.41
Syf2-201ENSMUST00000030622 Abca5Q8K448 1642 aa23.83■■□□□ 1.4
Syf2-201ENSMUST00000030622 Pcf11G3X9Z4 1553 aa23.82■■□□□ 1.4
Syf2-201ENSMUST00000030622 NefmP08553 848 aa23.81■■□□□ 1.4
Syf2-201ENSMUST00000030622 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
Syf2-201ENSMUST00000030622 AI481877A2ALV5 1481 aa23.81■■□□□ 1.4
Syf2-201ENSMUST00000030622 Peg3Q3URU2 1571 aa23.8■■□□□ 1.4
Syf2-201ENSMUST00000030622 WrnO09053 1401 aa23.79■■□□□ 1.4
Syf2-201ENSMUST00000030622 Setbp1Q9Z180 1582 aa23.75■■□□□ 1.39
Syf2-201ENSMUST00000030622 CntlnA2AM05 1397 aa23.75■■□□□ 1.39
Syf2-201ENSMUST00000030622 Pprc1Q6NZN1 1644 aa23.75■■□□□ 1.39
Syf2-201ENSMUST00000030622 Naip1Q9QWK5 1403 aa23.75■■□□□ 1.39
Syf2-201ENSMUST00000030622 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa23.71■■□□□ 1.39
Syf2-201ENSMUST00000030622 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa23.7■■□□□ 1.38
Syf2-201ENSMUST00000030622 Igf1rQ60751 1373 aa23.7■■□□□ 1.38
Syf2-201ENSMUST00000030622 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa23.69■■□□□ 1.38
Syf2-201ENSMUST00000030622 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Syf2-201ENSMUST00000030622 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa23.66■■□□□ 1.38
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa23.65■■□□□ 1.38
Syf2-201ENSMUST00000030622 BlmO88700 1416 aa23.63■■□□□ 1.37
Syf2-201ENSMUST00000030622 Kdm5bQ80Y84 1544 aa23.62■■□□□ 1.37
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ak9G3UYQ4 1894 aa23.58■■□□□ 1.37
Syf2-201ENSMUST00000030622 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa23.58■■□□□ 1.37
Syf2-201ENSMUST00000030622 Aebp1Q640N1 1128 aa23.54■■□□□ 1.36
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.54■■□□□ 1.36
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa23.54■■□□□ 1.36
Syf2-201ENSMUST00000030622 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Syf2-201ENSMUST00000030622 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa23.49■■□□□ 1.35
Syf2-201ENSMUST00000030622 Arid3cA6PWV5 409 aa23.49■■□□□ 1.35
Syf2-201ENSMUST00000030622 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa23.49■■□□□ 1.35
Syf2-201ENSMUST00000030622 Wdr7Q920I9 1489 aa23.48■■□□□ 1.35
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ncoa2Q61026 1462 aa23.47■■□□□ 1.35
Syf2-201ENSMUST00000030622 Kif27Q7M6Z4 1394 aa23.46■■□□□ 1.35
Syf2-201ENSMUST00000030622 NhsB1AV60 1647 aa23.41■■□□□ 1.34
Syf2-201ENSMUST00000030622 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa23.39■■□□□ 1.34
Syf2-201ENSMUST00000030622 Atp10dQ8K2X1 1416 aa23.39■■□□□ 1.33
Syf2-201ENSMUST00000030622 Znf608Q56A10 1511 aa23.37■■□□□ 1.33
Syf2-201ENSMUST00000030622 Ttc37F8VPK0 1563 aa23.37■■□□□ 1.33
Syf2-201ENSMUST00000030622 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa23.36■■□□□ 1.33
Syf2-201ENSMUST00000030622 Fancd2Q80V62 1450 aa23.36■■□□□ 1.33
Syf2-201ENSMUST00000030622 AdgbG3UZ78 1657 aa23.32■■□□□ 1.32
Syf2-201ENSMUST00000030622 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa23.32■■□□□ 1.32
Syf2-201ENSMUST00000030622 Zfyve16Q80U44 1528 aa23.32■■□□□ 1.32
Syf2-201ENSMUST00000030622 Magi1Q6RHR9 1471 aa23.32■■□□□ 1.32
Syf2-201ENSMUST00000030622 Mroh2aD3Z750 1679 aa23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms