RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-53P01767 116 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF56Q15929 161 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM19A2Q8N3H0 131 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ST20Q9HBF5 79 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00612Q8N6U2 182 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf90A8MZG2 172 aa16.77■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 VCYO14598 125 aa16.77■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4C5Q8NGB2 326 aa16.77■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZTI0 123 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00518Q8N0U6 118 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC30Q96LL9 226 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 FCER1GP30273 86 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 LYRM9A8MSI8 78 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TCAPO15273 167 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 LEPROTL1O95214 131 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 G0S2P27469 103 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 LAGE3Q14657 143 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ORMDL2Q53FV1 153 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM70Q9BUB7 260 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPB8Q9UJY1 196 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01549A6NIU2 74 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 HBDP02042 147 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PYY3Q5JQD4 70 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DAD1P61803 113 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 C15orf53Q8NAA6 179 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A096LNJ9 63 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TRGV2A0A075B6R0 118 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf223Q8N319 242 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 KIR2DL4Q99706 377 aa16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE12BA1L429 117 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE7O76087 117 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE12FP0CL80 117 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE12GP0CL81 117 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE12IP0CL82 117 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PMCHL1Q16048 86 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZSN1 163 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 Q8N1X5 172 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF479Q96JC4 524 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf79P0CE67 100 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA12Q7Z6I5 190 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 FAT1Q14517 4588 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa16.66■□□□□ 0.26
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CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf57Q99622 126 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 I3L3M4 83 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTDAPP60985 99 aa16.64■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOHQ15669 191 aa16.64■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa16.64■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00588Q9Y4M8 146 aa16.64■□□□□ 0.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PET117Q6UWS5 81 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 K7EQD1 137 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5LO75964 103 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT3O95989 172 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 FHL2Q14192 279 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TOMM6Q96B49 74 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SCGB1D1O95968 90 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB130BP0DP73 79 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB130AP0DP74 79 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 Q8N976 141 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00173Q6ZV60 143 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 IFI27L1Q96BM0 104 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 F5H768 121 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TSHBP01222 138 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP10-2P60368 255 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 C20orf202A1L168 122 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PRADC1Q9BSG0 188 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CYSLTR1Q9Y271 337 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5G1P05496 136 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL18P55774 89 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 NEGR1Q7Z3B1 354 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ERASQ7Z444 233 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2D3P61077 147 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2D2P62837 147 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-216ENST00000628306 S100A12P80511 92 aa16.54■□□□□ 0.24
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