RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-208	ENST00000587914	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-208	ENST00000587914	VCX2	Q9H322	139 aa		5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-208	ENST00000587914	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-208	ENST00000587914	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-208	ENST00000587914	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		5.22	□□□□□ -1.57
EFTUD2-208	ENST00000587914	PTPN13	Q12923	2485 aa		5.21	□□□□□ -1.57
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914		H3BUT2	72 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	AMELX	Q99217	191 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		5.21	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914		A4D1N5	150 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	LEPROT	O15243	131 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGLV1-51	P01701	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	C12orf74	Q32Q52	190 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	MUC4	Q99102	2169 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914		J3QQQ9	107 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	HTN1	P15515	57 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	PROK1	P58294	105 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	COTL1	Q14019	142 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914		A0A0A0MQY5	61 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914		A0A0J9YY99	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGLL5	B9A064	214 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	SAP30	O75446	220 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	RRN3P1	Q2M238	152 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	C16orf74	Q96GX8	76 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	XCL2	Q9UBD3	114 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914		K7ERU9	68 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	AZU1	P20160	251 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	UBE2D1	P51668	147 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	POLQ	O75417	2590 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914		H7C423	109 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914		K7EQD1	137 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914		K7ERJ3	54 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	INSL3	P51460	131 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM104A	Q969W3	186 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		5.16	□□□□□ -1.58
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914		A0A0J9YXV3	536 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM238	C9JI98	176 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914		F8W1H4	67 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGHV3-30	P01768	117 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	EMP1	P54849	157 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	RNF183	Q96D59	192 aa		5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
EFTUD2-208	ENST00000587914	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		5.15	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms