RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 Q8NAQ8 132 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TOMM6Q96B49 74 aa8.44□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12BA1L429 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE7O76087 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 SCGB1D1O95968 90 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12FP0CL80 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12GP0CL81 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12IP0CL82 117 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 FHL2Q14192 279 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.43□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.43□□□□□ -1.06
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GGA3-217ENST00000583667 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 NUDT3O95989 172 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TSHBP01222 138 aa8.42□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.42□□□□□ -1.06
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GGA3-217ENST00000583667 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 K7EQD1 137 aa8.41□□□□□ -1.06
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GGA3-217ENST00000583667 ERASQ7Z444 233 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.41□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 C20orf202A1L168 122 aa8.4□□□□□ -1.06
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GGA3-217ENST00000583667 P0DMU3 169 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 FAM231AP0DMU4 169 aa8.4□□□□□ -1.06
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GGA3-217ENST00000583667 S100A12P80511 92 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-217ENST00000583667 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
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GGA3-217ENST00000583667 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.39□□□□□ -1.07
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GGA3-217ENST00000583667 ATP5G1P05496 136 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 PRSS1P07477 247 aa8.35□□□□□ -1.07
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GGA3-217ENST00000583667 PKIAP61925 76 aa8.35□□□□□ -1.07
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GGA3-217ENST00000583667 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 A0A087WX48 190 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GVY2 172 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 H7C423 109 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZN92 141 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-217ENST00000583667 VAMP8Q9BV40 100 aa8.34□□□□□ -1.07
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GGA3-217ENST00000583667 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 GAGE12JA6NER3 117 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 H3BNG1 76 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 DEFB4AO15263 64 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-217ENST00000583667 GAGE1Q13065 139 aa8.32□□□□□ -1.08
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