RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.68□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 SMLR1H3BR10 107 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 UBE2L6O14933 153 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 STPG4Q8N801 248 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.67□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 A0A0J9YXV3 536 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 AMTP48728 403 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 CFAP161Q6P656 301 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 NIT2Q9NQR4 276 aa9.66□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 A0A096LNI7 61 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 CACNG7P62955 275 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.65□□□□□ -0.86
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP10-8P60410 259 aa9.64□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 COTL1Q14019 142 aa9.64□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 UMAD1C9J7I0 102 aa9.63□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 CENPWQ5EE01 88 aa9.63□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 TRGC1P0CF51 173 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 C11orf52Q96A22 123 aa9.62□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 F2Z2F3 143 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 REG3GQ6UW15 175 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.61□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 NTF3P20783 257 aa9.6□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 RAB19A4D1S5 217 aa9.59□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 CCL20P78556 96 aa9.59□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF345Q14585 488 aa9.59□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa9.59□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 GNG13Q9P2W3 67 aa9.59□□□□□ -0.87
SPNS2-208ENST00000576635 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 XKRY2A2RUG3 117 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 GAS8-AS1O95177 125 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 IFNA1P01562 189 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 FOXI1Q12951 378 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 GATD1Q8NB37 220 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 MANBALQ9NQG1 85 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 CTRLP40313 264 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 GNG4P50150 75 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 FGF6P10767 208 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 Q6ZRP5 223 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 C9orf62Q8N4C0 152 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 SMIM12Q96EX1 92 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 BCL2L11O43521 198 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 NCR2O95944 276 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 APCSP02743 223 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 XCL1P47992 114 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 TWIST1Q15672 202 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 AKAP14Q86UN6 197 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 CARD19Q96LW7 228 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 HMSDA8MTL9 139 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 H7C423 109 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 CNFNQ9BYD5 112 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 CCL25O15444 150 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 NUDT11Q96G61 164 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS2-208ENST00000576635 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.52□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.52□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.52□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 FAM231BA6NCW3 169 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 SYCNQ0VAF6 134 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 BIN3Q9NQY0 253 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 MED9Q9NWA0 146 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 LPAP08519 4548 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 PTTG1IPP53801 180 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 BTF3L4Q96K17 158 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.49□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 PDE6DO43924 150 aa9.49□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 TMEM101Q96IK0 257 aa9.49□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 A0A1W2PNN7 141 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 I3L3M4 83 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 GAGE2BQ13066 116 aa9.48□□□□□ -0.89
SPNS2-208ENST00000576635 K7EN84 100 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms