RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 IGKCP01834 107 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 TCTAP57738 103 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM141Q96I45 108 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 TIMM17AQ99595 171 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SPNS1-212ENST00000568900 DEFB4AO15263 64 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 CIDEAO60543 219 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 F8VRH5 84 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 COTL1Q14019 142 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 GAGE12JA6NER3 117 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 G3V4G9 280 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 GAGE1Q13065 139 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 GAGE4Q13068 117 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 GAGE5Q13069 117 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 GAGE13Q4V321 117 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 FHL2Q14192 279 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 PLNP26678 52 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 RNF183Q96D59 192 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 PMVKQ15126 192 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 UBE2D3P61077 147 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 UBE2D2P62837 147 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 ANK2Q01484 3957 aa14.77□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 LYRM9A8MSI8 78 aa14.77□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 MIFP14174 115 aa14.77□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 Q8NAQ8 132 aa14.77□□□□□ -0.04
SPNS1-212ENST00000568900 CST9LQ9H4G1 147 aa14.77□□□□□ -0.04
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SPNS1-212ENST00000568900 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SPNS1-212ENST00000568900 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.75□□□□□ -0.05
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SPNS1-212ENST00000568900 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.75□□□□□ -0.05
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SPNS1-212ENST00000568900 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.73□□□□□ -0.05
SPNS1-212ENST00000568900 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.72□□□□□ -0.05
SPNS1-212ENST00000568900 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.72□□□□□ -0.05
SPNS1-212ENST00000568900 VCX2Q9H322 139 aa14.72□□□□□ -0.05
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SPNS1-212ENST00000568900 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.72□□□□□ -0.05
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SPNS1-212ENST00000568900 PCP2Q8IVA1 136 aa14.71□□□□□ -0.05
SPNS1-212ENST00000568900 FAM104AQ969W3 186 aa14.71□□□□□ -0.05
SPNS1-212ENST00000568900 SPANXA1Q9NS26 97 aa14.71□□□□□ -0.05
SPNS1-212ENST00000568900 NOTCH1P46531 2555 aa14.71□□□□□ -0.06
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SPNS1-212ENST00000568900 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-212ENST00000568900 PRO0255Q9UI72 69 aa14.68□□□□□ -0.06
SPNS1-212ENST00000568900 LINC00694P0DN24 101 aa14.67□□□□□ -0.06
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SPNS1-212ENST00000568900 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-212ENST00000568900 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-212ENST00000568900 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-212ENST00000568900 CHAC1Q9BUX1 264 aa14.66□□□□□ -0.06
SPNS1-212ENST00000568900 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-212ENST00000568900 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-212ENST00000568900 A0A0J9YXV3 536 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-212ENST00000568900 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.64□□□□□ -0.07
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