RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 CIDEAO60543 219 aa13.36□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 IGLC3P0DOY3 106 aa13.36□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 CELA1Q9UNI1 258 aa13.36□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa13.35□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 K7EQD1 137 aa13.35□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 FHL2Q14192 279 aa13.35□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 ODF1Q14990 250 aa13.35□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.35□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 G0S2P27469 103 aa13.35□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 TCTAP57738 103 aa13.35□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.35□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 TSHBP01222 138 aa13.34□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 DNAJC30Q96LL9 226 aa13.34□□□□□ -0.27
INO80E-211ENST00000567987 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.33□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 ERASQ7Z444 233 aa13.33□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.33□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.32□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 DAD1P61803 113 aa13.32□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 RHOHQ15669 191 aa13.32□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 STPG4Q8N801 248 aa13.32□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.31□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 MRAPQ8TCY5 172 aa13.31□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.31□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 IGKCP01834 107 aa13.31□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 BAALCQ8WXS3 180 aa13.31□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 A0A087WX48 190 aa13.3□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.3□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 TP73-AS1Q9UF72 201 aa13.3□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.3□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.29□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 GAGE12JA6NER3 117 aa13.29□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 DPM2O94777 84 aa13.29□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 GAGE1Q13065 139 aa13.29□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 GAGE4Q13068 117 aa13.29□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 GAGE5Q13069 117 aa13.29□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 GAGE13Q4V321 117 aa13.29□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.29□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 TENM3Q9P273 2699 aa13.28□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 LINC01549A6NIU2 74 aa13.28□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa13.27□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 IGIPA6NJ69 53 aa13.27□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.27□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 ZMAT4Q9H898 229 aa13.27□□□□□ -0.28
INO80E-211ENST00000567987 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.27□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 UBE2D3P61077 147 aa13.26□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 UBE2D2P62837 147 aa13.26□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa13.26□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.26□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 SLC25A34Q6PIV7 304 aa13.26□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 TMEM141Q96I45 108 aa13.26□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 SPATA25Q9BR10 227 aa13.26□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 TM2D3Q9BRN9 247 aa13.26□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 F8VRH5 84 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 ATP5G1P05496 136 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 CRYBA4P53673 196 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 TIMM17AQ99595 171 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 A0A0J9YWU9 116 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 PLNP26678 52 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 NMUP48645 174 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 COTL1Q14019 142 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 PRO0255Q9UI72 69 aa13.25□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 EREGO14944 169 aa13.23□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 C12orf74Q32Q52 190 aa13.23□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 HTN3P15516 51 aa13.23□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 M0R143 59 aa13.22□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 COX8AP10176 69 aa13.22□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 GYPEP15421 78 aa13.22□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 PMVKQ15126 192 aa13.22□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 BATFQ16520 125 aa13.22□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.22□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 F5H768 121 aa13.21□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 PAX4O43316 350 aa13.21□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 CHCHD7Q9BUK0 85 aa13.21□□□□□ -0.29
INO80E-211ENST00000567987 A0A0J9YY99 117 aa13.21□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 CST9LQ9H4G1 147 aa13.21□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 LINC00694P0DN24 101 aa13.2□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13.2□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 VSIG2Q96IQ7 327 aa13.2□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.19□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.18□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 PCP2Q8IVA1 136 aa13.18□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa13.17□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 Q6ZTC4 211 aa13.17□□□□□ -0.3
INO80E-211ENST00000567987 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms